Когда в 1995 году началось восстановление Кылтовского монастыря, от него остался лишь сестринский корпус да частично уцелевший собор. К 2008 году был отремонтирован сестринский корпус. На втором этаже здания обустроена маленькая домовая церковь Афанасия Великого. В обители проживают монахини, церковь действует, проводятся службы.
