Первоначально фонд музея начал формироваться в 1966 году. Тогда члены Московского отделения Союза художников подарили первые картины колхозу «Кавказ».
В истории музея сыграл немаловажную роль ветеран Великой Отечественной войны Иван Иванович Протасов, который увлекшись идеей музея, предложил не ограничиваться только выставочным показом изобразительного искусства, а создать и исторический отдел.
Иван Иванович Протасов — первый директор колхозного музея, активно начал работу по сбору материала об истории станицы Курганной и истории колхоза.
Подаренные картины и скульптуры первоначально разместили в холле 2-го этажа колхозного Дворца культуры. Но художники с завидным постоянством пополняли фонд колхозной галереи. Фонд музея был также пополнен картинами, переданными по закупке краевым художественным музеем им. Коваленко (в то время музей им. Л.В. Луначарского)».
Пополнение фондов музея истории колхоза «Кавказ» шло путем собирания экспонатов среди местного населения. Эту работу проводил сам Иван Иванович Протасов. Благодаря его кропотливому труду была заложена основа для будущего раздела
бытовой культуры местного населения начала двадцатого века. С большой отзывчивостью станичники отнеслись к собирательской деятельности И. И. Протасова. Каждый стремился внести свой посильный вклад в создание нового раздела в музее.
С открытием нового Дворца культуры в 1965 году в одном из помещений И. И. Протасовым было предложено открыть и музей.
В те годы частыми гостями у курганинцев были ветераны, партизаны гражданской и Отечественной войн, ветераны труда, которые были готовы оставить на память будущим поколениям частичку прошедшей истории в виде фотографий, личных вещей.
В 1972 году Андрей Петрович Хомяков предложил построить отдельное здание музея. Предложение единодушно было принято.
Строили здание музея по проекту заслуженного архитектора РСФСР А.В. Титова. Это единственный в сельской местности Краснодарского края музей, расположившийся в специально построенном для него здании.
Двухэтажное здание музея со стеклянной крышей стало одним из украшений центральной части города Курганинска.
На первом этаже разместился музей колхоза «Кавказ», повествующий об истории города и колхоза, а на втором этаже — картинная галерея, ставшая филиалом краевого художественного музея им. Ф.А.Коваленко — с 1 октября 1975 года (в советское время имя А. В. Луначарского).
Приказом Министерства культуры РСФСР от 23 декабря 1980 года № 758 музею было присвоено звание «Народный музей». В 1993 году музей был реорганизован в Курганинский исторический музей.
За эти годы фонды музея выросли до 23 тысяч экспонатов! Эго огромный архив документов, фотографий. Эго десятки коллекций.
По скромным подсчетам, музей посетили за 53 года его жизни около 900 тысяч человек. Проведено более тридцати тысяч экскурсий.
