Создан в 1992 году первоначально как Крымскотатарская национальная галерея при общественной организации «Крымскотатарский фонд культуры». Основу коллекции составили произведения крымскотатарских художников, отобранные с первой Всесоюзной выставки крымскотатарских художников, прошедшей в марте — апреле 1990 года в Крымском Доме художника, открыта 19 марта 1990 года. Выставка была организована Координационным центром по возрождению крымскотатарской культуры и Крымской организацией Союза художников Украины; инициаторами выставки были И. А. Заатов и М. Ю. Чурлу. С 1993 года Крымскотатарская национальная галерея была передана в структуру Ассоциации крымскотатарских художников. В дальнейшем формирование фондов галереи и её выставочная деятельность проходила под руководством Ассоциации.
Важным событием в этапе становления национальной галереи в 1993 году стал подписанный трёхсторонний Договор между Ассоциацией крымскотатарских художников, председатель Э. С. Изетов, Государственным комитетом по делам национальностей и депортированных граждан Автономной Республики Крым, председатель Р. И. Джемилев и Симферопольским художественным музеем, директор Н. Д. Дьяченко, где каждая из сторон брала на себя обязанности. По данному Договору Государственный комитет по делам национальностей и депортированных граждан гарантировал финансирование на приобретение новых экспонатов для пополнения фондов галереи, Симферопольский художественный музей — сохранность экспонатов и выделение помещения для хранения экспонатов, Ассоциация крымскотатарских художников — формирование фондов и популяризацию новых произведений изобразительного искусства в выставочной деятельности. В июле 1996 года Крымскотатарская национальная галерея была передана в Республиканскую крымскотатарскую библиотеку им. И. Гаспринского и переименована в Музей изобразительного искусства крымских татар, как один из отделов в структуре Республиканской крымскотатарской библиотеки им. И. Гаспринского. А в 1998 году Музей изобразительного искусства был переименован в Музей крымскотатарского искусства на правах филиала Республиканской крымскотатарской библиотеки им. И. Гаспринского. С 14 декабря 1999 года — новая страница в истории Национального музея: постановлением Правительства Автономной Республики Крым Музей крымскотатарского искусства приобрёл юридический статус, став отдельным учреждением культуры. С 2000 года музей переименован в Республиканский крымскотатарский музей искусств и находится в структуре Министерства культуры АР Крым. С момента создания крымскотатарского музея искусств в разные периоды его деятельностью руководили сотрудники Э. Черкезова, Ф. Асанова, И. Заатов. В настоящее время деятельностью музея руководит директор С. Эминова.
Крымскотатарский музей искусств является научно-методическим центром по собиранию, сохранению, изучению и популяризации культурного и исторического наследия крымскотатарского народа.
В настоящее время Музей состоит из 6 отделов:
— Отдел декоративно-прикладного искусства;
— Отдел изобразительного искусства;
— Отдел истории музыки, танца, театра и кино;
— Музей исламского искусства;
— Музей Амет-Хана Султана;
— Отдел экспозиционно-выставочной работы.
Первыми экспонатами музея, которые легли в Основу Фонда Музея, стали произведения живописи, графики, скульптуры и предметы декоративно-прикладного искусства современных крымскотатарских художников: Э. Изетова, А. Алиева, Р. Усеинова, М. Чурлу, Р. Нетовкина, И. Аблаева, З. Трасиновой, С. Османова, Р. Эминова, Н. Якубова, А. Билялова, И. Велиуллаева, И. Шейх-Задэ, А. Усеинова, Х. Мемедляева, А. Сейт-Аметова, С. Якубова, А. Сейдаметова, которые были отобраны членами экспертной комиссии в составе научных сотрудников Симферопольского художественного музея — Р. Т. Подуфалого, Г. И. Федотовой, Л. М. Рыбниковой, Л. Я. Лениченко, — и членов Союза Художников Украины А. С. Шуринова, С. А. Никитина, М. Ю. Чурлу. Все отобранные работы авторов были в экспозиции первой Всесоюзной выставки крымскотатарских художников, прошедшей в Крымском Доме художника.
Значительным пополнением фондов музея в 1994 году стали предметы крымскотатарского национального декоративно-прикладного искусства, переданные из частной коллекции А. Умерова и Х. Добра. В 2005 году фонды музея пополнились факсимильными картинами немецкого художника и этнографа середины XIX века Августа Вильгельма Кизеветтера, которые были переданы в дар музею Берлинской картинной галереей. Также в Фондах Музея хранятся ценнейшие коллекции декоративно-прикладного искусства XVIII—XX веков, изобразительного искусства, коллекции старинных книг, фотографий, открыток и монет. Уникальные материалы, раскрывающие деятельность крымскотатарского театра, музыкальных, танцевальных, фольклорных коллективов, экспонаты, отражающие жизнь и деятельность легендарного лётчика Амет-Хана Султана, фотографии героев и участников Великой Отечественной войны, ценные материалы об истории крымскотатарского национального движения.
С 1992 года по 2007 год экспонаты фонда крымскотатарского музея искусств находились на хранении в фондах Симферопольского художественного музея, а с 2007 года основная часть экспонатов — на хранении в фондах Крымского краеведческого музея.
На сегодняшний день в коллекции Музейного фонда насчитывается более 5000 экспонатов.
Сотрудниками Музея ведутся исследовательские работы в различных аспектах крымскотатарской культуры: художественное оружие XVII—XVIII вв., художественная обработка металла, орнаментальное ткачество и вышивка, история костюма, исламского искусства, анализ творчества довоенного и современного периодов крымскотатарского изобразительного и декоративно-прикладного искусства, творчества артистов и др. Результатами этих поисков являются выступления на конференциях, чтение лекций, содержательные публикации в научных сборниках, на страницах газет, журналов. Ежемесячно музей проводит стационарные и выездные выставки разной тематики.
