Колокольня расположена на Торговой стороне на Ярославовом Дворище в нескольких метрах западнее Никольского собора и севернее церкви Жен Мироносиц. С двух сторон колокольню охватывает каменный двухэтажный корпус, городское училище XIX века, закрывающий два-три её нижних яруса, корпус связывает колокольню с воротной башней гостиного двора.
В дореволюционной и советской литературе колокольня датируется концом XVII века. В 1970 году С.И. Сивак обнаружила в библиотеке Академии Наук сильно испорченную рукопись конца XVII века, в которой содержались сведения о строительных работах на Ярославовом Дворище. Из документа следует, что памятник сооружен за два осенне-летних сезона 1684-1685 годах. Окончание работ приходится на сентябрь 1685 года. На колокольне висели несколько колоколов, по данным на середину XIX века 6, конце XIX века 8, наибольшей из которых, весом 61 пуд, был отлит в 1652 году. В конце 1687 года этот колокол отвезли в Москву, а взамен привезли и повесили только что отлитый колокол весом 106 пудов.
Колокольня пострадала во время сильнейшего пожара 1696 года, когда на Торговой стороне сгорели все церкви и лавки, кроме церкви Бориса и Глеба.
В годы Великой Отечественной войны памятник пострадал не столь значительно, как другие здания города, в стенах имелись повреждения от пуль и снарядов, повреждено покрытие шатра, отсутствовали полы и заполнения проемов.
В настоящее время колокольня существенных утрат не имеет, утрачена большая часть колоколов, сохранились только два из них.
Памятник относится к числу пятиярусных шатровых колоколен типа «восьмерик на четверике». Внутри колокольня разделена сводами или перекрытиями на пять ярусов. Храм характерный образец шатровой колокольни, распространенной в Новгороде в конце XVII века. Имеет важное градостроительное значение.