Онисим Егорович Клер родился в коммуне Корсель кантона Невшатель в семье служащего. Окончил Невшательскую промышленную школу в Швейцарии в 1862 году. В том же году приехал в Российскую империю, поскольку семейные обстоятельства не позволили ему поступить в университет на родине.
Получил должность гувернёра у князей Трубецких.
Сдал экзамены в Императорском Санкт-Петербургском университете на право преподавать французский язык в учебных заведениях.
Около трех лет преподавал французский в Москве, затем около двух лет работал в Ярославле, где участвовал в работе местного естественнонаучного общества.
В 1867 году переехал в город Екатеринбург, где в 1861 году открылась мужская гимназия, и было вакантное место учителя французского языка. Работал преподавателем французского языка в мужской гимназии, в реальном училище.
Интересоваться природой и достопримечательностями в окрестностях Екатеринбурга. В этом он нашел союзников в лице нового директора гимназии В. В. Всеволодова, управляющего Горным училищем Н. К. Чупина и других своих коллег по гимназии. Вскоре он высказал предложение создать подобное «общество любителей естествознания» на Урале и был поддержан.
Так в стенах гимназии по инициативе её преподавателей зародились «Уральское общество любителей естествознания» (УОЛЕ) и краеведческий музей.
Хранитель музея, президент УОЛЕ. Опубликовал около 60 работ по краеведению.
До самой своей смерти в 1920 году Онисим Егорович был бессменным секретарём, а затем президентом УОЛЕ.
Скоропостижно скончался от тифа 18 января 1920 года. Похоронен на Лютеранско-католическом кладбище Екатеринбурга, могила утеряна.