Первый храм в обители был построен приблизительно в 1629-1645 годах, в царствование первого царя из Дома Романовых – Михаила Федоровича. Главный престол был освящен в честь Казанской иконы Божией Матери. Придел в честь прп. Алексия, человека Божия, в каменной трапезной церкви был устроен «иждивением Иоанна и Петра Алексеевичей».
В царствование Екатерины II обитель уже была обнесена каменной оградой, о чем свидетельствует план 1776 года, но кельи были и оставались деревянными и до закрытия монастыря в 1922 году.
В 1823 году при игумении Августе в трапезной пристройке был устроен с севера придел в честь Ченстоховской иконы Божией Матери.
Из очерка Алексея Знаменского в Калужских Губернских ведомостях за 1889 год №55 мы узнаем, что «все постройки кроме храма внутри монастыря были деревянные, а в плане города монастырь значился каменным, поэтому 11 ноября 1828 года игумения Ангелина шлет прошение «Его Превосходительству Господину Калужскому Губернатору» изменить план города в квартале, где расположен монастырь, разрешить деревянные постройки внутри ограды монастыря. Игумения ссылается на то, что монастырь находится под горой, отделен каменной оградой и зеленью, все келии деревянные, большинство их является личной собственностью монахинь, которые ни сил, ни средств перестраивать келии не имеют. Игумения Ангелина просит разрешения и далее строить деревянные келии, как более пригодные для жизни больных и престарелых монахинь. На что она получила милостивое разрешение».
Епископ Филарет (Амфитеатров) в 1820-1821 годах писал в столицу: «В Калужской епархии состоит только один женский монастырь внутри города Калуги. Местное положение его так тесно, что живущие в нем сестры с великим трудом едва могут помещаться…».
При игумении Ангелине (Яновской) началось строительство нового трехпрестольного храма, для чего старый был разобран.
Освящение соборного монастырского храма состоялось 6 июля 1903 года. По описанию дореволюционного краеведа Д.И. Малинина «Стиль здания – византийский с пятью куполами, из коих средний 11 аршин в диаметре. Купол поддерживается четырьмя столбами, арки высокие. На западной стороне – хоры. Иконостас четырехъярусный, живопись современная».
После революции монастырь, ликвидированный декретом рабочее-крестьянского правительства в 1918 году, был восстановлен монахинями под видом 1-ой женской трудовой артели. В 1922 году монастырь был упразднен, все 118 проживавших там монахинь выселены в двухнедельный срок. Его насельницы разделили судьбу многих верующих людей, были подвергнуты репрессиям, погибли в тюрьмах, лагерях. В дни фашистской оккупации немцы устроили на территории монастыря гетто, которое при отступлении подожгли, и все деревянные келии сгорели.
Монастырь в виде монашеской общины был возобновлен 10 февраля 1992 года. Община сформировалась из сестер Сестричества в честь преподобномученицы Великой княгини Елисаветы, которое существовало при благотворительном отделе епархии. Жили сестры в маленьком деревянном домике, неподалеку от Никольского храма г. Калуги, в который они и ходили, т.к. прежняя территория Казанского девичьего монастыря и монастырский собор как тогда, так и сейчас Церкви не возвращены. Этот домик был много лет резиденцией епархиальных архиереев во времена гонений на церковь.
С прибытием на Калужскую кафедру Архиепископа Климента епархии было возвращено здание семинарии, а общинка разместилась в этом намоленном домике.
26 декабря 1995 года Священный Синод благословил открытие Казанского девичьего монастыря. С 1995 по 2007 год монастырь размещался в здании бывшего там до революции Духовного училища, где кроме него находились Православная гимназия (более двухсот детей) и Калужское Духовное училище с пансионом на 60 воспитанниц. Домовый храм в честь свт. Гурия Казанского, освященный архиепископом Климентом в 1995 году, был монастырским.
Здание соборного монастырского храма в честь Казанской иконы Божией Матери до сих пор епархии не передано. Но в 2012 году был выделен участок земли рядом с соборным храмом для строительства сестринского корпуса.
Правда, участок этот мало пригоден для строительства, но все же это событие вселяет надежду на скорое возрождение древнейшего в Калужской епархии женского монастыря.
19 марта 2017 года в храме свт. Гурия Казанского совершаются службы по воскресным и праздничным дням.