Летом 1837 года под размещение училища за 72 тысячи рублей был куплен один из лучших домов в городе — это был дом купца Я. И. Билибина, находившийся в Архангельском переулке (ныне улица Дарвина).
Три года, до сентября 1840 года в доме велись перестройки под нужды училища, и лишь после этого здесь начались учебные занятия.
В 1903 г. на съезде епархиального духовенства было принято решение о строительстве храма в духовном училище. 1 декабря 1904 г. училищный храм был освящен в честь Гурия Казанского
Училище было закрыто в 1918 г.
В 1992 году Калужское духовное училище было вновь открыто. Преподавательский состав был сформирован из духовенства епархии. Программа обучения составлена по образцу московских духовных школ, курс обучения — 3 года.
Здание бывшего духовного училища (ул. Дарвина, 13/33) было передано епархии 3 августа 1995 г. К этому моменту здесь размещались Калужский медико-технический лазерный центр, агентство поддержки малого бизнеса, швейная мастерская, ломбард, экономическая школа и другие организации и фирмы.
С августа 1995 г. в здании духовного училища размещался Казанский девичий монастырь. В 2011 г. монастырь переехал в восстановленные монастырские здания в д. Спас.
В 1996 году училище преобразовано в семинарию, с переходом на 4-х летний курс обучения.
Указом Священного Синода от 7 июля 2002 года Калужское женское епархиальное училище было преобразовано в Калужское духовное училище (с набором учащихся обоего пола), 31 августа 2002 года состоялось его открытие.