Начинался монастырь в 1863 году из богадельни с насельницами под управлением Неониллы Честновой. Этому событию предшествовал случай. В 1863 году богатые выксунские купцы решили совершить доброе дело, учредить богадельню. Выбрать для неё место пригласили прп. Варнаву из Свято-Троице-Сергиевой Лавры. Прибыв в Выксу, он отправился в лес и неожиданно воткнул ветку в самой чаще. Там и построили дом, где поселились три монахини, 12 богаделок-насельниц и юродивый Димитрий Пивоваров, оберегавший их от опасности. К осени 1864 года было закончено строительство двухэтажного здания с кельями и трапезной. Ещё через год Варнава прислал в богадельню Иверскую икону Божией Матери — отсюда посвящение. Около ста лет назад монастырские иконописцы сделали с неё чудотворный список; оригинальная икона старца Варнавы, увы не сохранилась. В 1868 году была освящена первая домовая церковь, разумеется, в честь Иверской иконы. В 1872 году началось строительство 5-ти главного соборного храма, вмещающего до 6000 молящихся одновременно. Статус общины богадельня получила в 1874 году. С тех пор и до 1882-го года ею управляла Мария Пивоварова. Именно при ней достроили каменный собор. А с 1882-го общину возглавила Митрофания Крюкова из Рыбинской Софийской обители, при ней, наконец, и выксунские насельницы обрели долгожданный монастырский статус.
Судьба Иверской обители в советские годы сложилась трагично. Уже в 1919 году монастырь закрыли. Летом 1927 года был взорван главный храм, рухнули главы, барабаны и своды с подпружными арками, хотя основные несущие стены выдержали подрыв и стали основой для последующего восстановления, заживо похоронив под руинами сестёр-схимниц, отказавшись покинуть обитель. В том же 1927-м была обрушена колокольня до нижних ярусов. Старожилы говорят, человек, которому поручили подрыв колокольни Иверского монастыря не хотел этого делать и заложил слабый заряд взрывчатки, причём заложил особым образом, лишь в верхнюю часть. Взрыв произошёл. Но колокольня выстояла, лишь обрушился купол и верхний ярус колокольни. В домике старца Варнавы, расположенном вне монастырских стен, по воспоминаниям выксунцев, жил Нарком тяжёлой промышленности Л. М. Каганович, когда приезжал с инспекцией местных заводов. Возрождение обители началось в конце ХХ века. В 1991 году была зарегистрирована религиозная община, в 1993-м году в церковной лавке был оборудован новый Иверский храм. В 1994-м году специалисты-архитекторы паспортизировали монастырский ансамбль, его взяли на госохрану как памятник регионального значения. В приход вернулась и святыня, список Иверской иконы Божией Матери, отреставрированный в Серафимо-Дивеевском монастыре. А при расчистке остатков Троицкого собора от завалов кирпича была обретена ещё одна Богородичная икона Тихвинская. В 1997 году община вновь стала монастырём. Началось восстановление главного храма, в 2003-м году был освящён притвор. До полного возрождения былого величия, конечно, ещё далеко, но дело движется. В домике старца Варнавы оборудован небольшой детский дом, под присмотром настоятельницы там живут девочки-сироты. Открыты странноприимный дом и трапезная для паломников. В здании бывшей купеческой гостиницы разместилось Выксунское православное Духовное училище, в котором организован Музей Иверского монастыря, где выставлены многочисленные фотографии и документы, а так же артефакты, найденные во время реставрационных работ. Восстановление колокольни началось в 2011 году. 8 февраля 2012 года в Иверский монастырь,на вертолёте МИ-8 был доставлен купол для Успенского храма. Купол был изготовлен в городе Переславле-Залесском. Затем собран на Выксунском металлургическом заводе и там же позолочен. 2 апреля 2012 года митрополит Георгий совершил чин освящения крестов и куполов для Успенской церкви и чин освящения колоколов. 23 октября того же года епископ Выксунский и Павловский Варнава совершил чин освящения купола и креста. В этот же день они были установлены на строящуюся монастырскую колокольню.
9 февраля 2016 года епископ Выксунский и Павловский Варнава освятил Великим чином храм в честь Успения Божией Матери. В середине образованного застройкой сквера установлен памятник преподобному Варнаве Гефсиманскому, торжественное открытие которого состоялось 22 мая 2011 года.