После освящения собора, в 1685 году началось строительство теплой церкви и трапезных палат.Три грандиозные бесстолпные трапезные были выстроены в западной части монастырской территории вторым этажом над «старыми каменными службами» середины столетия. Трапезные палаты и церковь Рождества Христова строились на средства царевны Татьяны Михайловны и были торжественно освящены в 1692 году. В настоящее время первый этаж Трапезных по главному восточному фасаду оформлен аркадой 1760 года. Она заменила первоночальное обширное гульбище. Как и гульбище, аркада — элемент, объединяющий скромный, с асимметрическим декором первый этаж с торжественным ритмически организованым вторым. В 1760-е годы на первом этаже церкви Рождества Христова были устроен Вертеп с приделами Поклонения Волхвов, Обрезания Господня, Бегства в Египет и Избиения младенцев.
Страницы книги Л.М. Чернениловой «Воскресенский Ново-Иерусалимский монастырь»
Замысел устроить в первом этаже храма Рождества Христова подобие Вифлеемского Вертепа и яслей относится ко времени строительства храма, но осуществлен он был только в конце XVIII века. Работы велись по плану архитектора Григория Бартенева, деньги на устроение Вертепа и «Вифлеемских» церквей пожаловала императрица Екатерина II, кроме того каждый придел имел своих вкладчиков. Близ Вертепа были устроены приделы Поклонения волхвов, Обрезания Господня, Бегства в Египет и Мучеников 14 000 младенцев, от Ирода в Вифлееме избиенных. В день Рождества Христова из верхнего храма в Святой Вертеп совершался торжественный крестный ход. После закрытия в 1919 году Воскресенского монастыря все убранство Вертепа и придельных церквей было уничтожено.
Корпус Трапезных палат сильно пострадал в 1941 году. В северной палате был разрушен свод, кровли на остальных помещениях сгорели вместе с деревянными конструкциями, но при этом храм Рождества Христова почти не получил повреждений. Во время реставрационных работ архитектурный облик интерьеров восстановлен в первоначальном виде. Фасады корпуса сохраняют сочетание форм и деталей XVII — XIX веков. 6 декабря 1997 года Рождественский трапезный храм был вновь освящен Патриархом Московским и всея Руси Алексием II.
По материалам: Зеленская Г.М. Святыни Нового Иерусалима. М., 2002. Зеленская Г.М. Воскресенский Ново-Иерусалимский монастырь: путеводитель паломника
Трапезные палаты с церковью Рождества Христова построены на «старых каменных службах» в 1686-1690 годах. Храм был освящён Патриархом Московским и всея Руси Адрианом. Царевна Татиана Михайловна Романова, младшая дочь царя Михаила Романова от брака со второй супругой Евдокией Лукъяновной Стрешневой, снабдившая церковь «всей необходимой утварью и ризницею», пожелала, чтобы центральная палата использовалась для молитв, вторая — для трапез монашествующей братии, а третья как «гостиная мирским ясти всяких чинов людям». Архитектура церкви Рождества Христова типична для русского зодчества конца ХVII столетия. Второй этаж храма представляет собой четверик с двумя рядами окон и сомкнутым сводом, на который поставлены два глухих восьмерика, завершённые главкой с крестом. Однако расположена церковь необычно. Она поставлена не по оси трапезных палат, а перпендикулярно к ним, напротив ротонды Воскресенского собора. Это обусловлено значением храма как образа Вифлеема. В первом ярусе церкви, под алтарём, устроено подобие пещеры Рождества Христова. Святой Вертеп и Святой Гроб симолически отражают друг друга, что соответствует православной иконографии, поскольку каменные ясли, куда был положен Богомладенец Христос, прообразуют Его погребальное ложе.
После реставрационно-восстановительных работ Пещера Рождества Христова была расписана евангельскими сюжетами, повествующими о Пришествии в мир Богочеловека. В данном случае иконография праздника принадлежит к развёрнутому варианту «Рождества Христова», включающему многочисленные сцены: Рождество Христово; Поклонение Ангелов младенцу; Поклонение пастухов; Беседа волхвов с царём Иродом; Принесение даров; Явление Ангела спящим волхвам; Явление Ангела Иосифу во сне и др. С конца ХVIII века вблизи Вертепа находятся приделы Поклонения волхвов, Обрезания Господня, Бегства в Египет и Мучеников 14 тысяч младенцев, от Ирода в Вифлееме избиенных. Церкви не имеют внешнего сходства с первообразами, но отражают полноту священных воспоминаний о месте, где благоволил родиться Спаситель мира.
Трапезный храм Рождества Христова освящён 6 декабря 1997 года Патриархом Московским и всея Руси Алексием II. 25 сентября 2011 года богослужение в Рождественской церкви совершил Святейший Патриарх Московский и всея Руси Кирилл.
Из книги-путеводителя: Воскресенский Ново-Иерусалимский ставропигиальный мужской монастырь. — Истра: Воскресенский Ново-Иерусалимский ставропигиальный монастырь, 2017