О поселении казаков на Дону известно ещё с XVI века. Станицы и городки-крепости обустраивались по всей донской степи. В те годы по ним фактически проходила граница Российского государства.
Городок Вёшки впервые упоминается в 1571 году, когда царь Иван Грозный подписал «Боярский приговор о станичной и сторожевой службе». Хотя история станицы Вёшенской началась намного раньше. Тогда вольные казаки основали на берегу Дона небольшое поселение, которые позже станет одним из главных центров казачества.
Выгодное месторасположение станицы способствовало её постоянному развитию. Через Вёшенскую проходили торговые пути, а плодородные земли и луга позволяли получать хороший урожай и заготавливать достаточное количество сена.
Казаки станицы Вёшенской принимали участие в многочисленных войнах, включая русско-японскую войну (1904-1905 гг.) и Первой мировую. Донские казаки сыграли огромную роль и во время Гражданской войны.
11 марта 1919 года в Вёшенская началось одно из самых крупных восстаний против новой большевистской власти, известное как Верхнедонское. Оно было связано с начатыми репрессиями против казаков, вернувшихся с различных фронтов Гражданской войны. Восстание носило стихийный характер, за оружие снова взялись десятки тысяч казаков. Это позволило выиграть время и создать Вооружённые силы Юга России (ВСЮР) — объединение белых войск под командованием Деникина в борьбе с красной армией.
Донское казачество сумело сдержать натиск большевиков и вскоре присоединилось к основным силам ВСЮР. Действия повстанцев позволили развить успешное наступление белой армии летом 1919 года.
Эти события подробно описаны в легендарном романе-эпопее Михаила Шолохова «Тихий Дон». Главный герой Григорий Мелехов командовал вёшенской дивизией казаков-повстанцев. Писатель знал, о чём рассказывал, потому что станица Вёшенская была его родиной. Сегодня здесь работает Государственный музей-заповедник М.А. Шолохова. Ежегодно в последние выходные мая в станице проходит фестиваль «Шолоховская весна».