Князе-Владимирский храм был основан в 1888 году в честь 900-летия крещения Руси князем Владимиром, на средства купца Василия Андреевича Литвинцева. В народе этот храм называли «белым» или «литвинцевским». Проект храма был составлен согласно желанию строителя Василия Литвинцева по проекту архитектора Владислава Кудельского.
Обитель была открыта 28 июля 1903 года на территории Знаменского предместья города.
Во время Русско-японской войны 1904—1905 годов в монастыре размещался госпиталь Красного креста. При монастыре была устроена мужская богадельня, церковно-учительская семинария и мужская школа. На устройство этих учреждений Литвинцев завещал 400 тыс. рублей серебром. Открытие церковно-учительской школы состоялось в 1900 году. В эту школу с трёхлетним курсом принимали выпускников церковно-приходских школ. В 1905 году школа на 50 учащихся была преобразована в семинарию и разместилась во вновь отстроенном здании. Кроме семинарии при монастыре располагалась двухлетняя образцовая школа на 75 учащихся. Школьный режим был очень строг: практиковались телесные наказания. Действовала при монастыре и богадельня.
Обитель просуществовала до 1922 года, когда была упразднена. После закрытия на территории монастыря размещался кавалерийский полк НКВД, детский дом и лаборатория геологического управления.
В конце 1990-х годов постройки монастыря переданы Иркутской епархии, и обитель была восстановлена.
В апреле 2001 на купола храма воздвигли кресты. В сентябре 2002 года реставрация Князе-Владимирского храма была завершена.
В настоящее время обитель действует в качестве приходского храма.
В Князь-Владимирском храме активно работает Центр бесплатной юридической помощи «Самарянин». Центр оказывает юридическую помощь по следующим вопросам: гражданское право, жилищное право, трудовое право, семейное право, право социального обеспечения. Отдельные вопросы по административному, налоговому, уголовному праву.