В январе 1797 года Иосиф де Рибас был отстранен от должности и отозван в Петербург.
Там ему дали звание адмирала и назначили заведовать Лесным департаментом. Но вскоре он впал в немилость и был отправлен в отставку.
Однако адмирал не забывает об основанном им портовом городе.
Он переписывается с одесским магистратом, дает советы, помогает решать важные для города вопросы.
Не без его совета городской магистрат обратился к императору с просьбой предоставить казенный кредит в размере 250 тысяч рублей на постройку Одесской гавани.
А поскольку Павел І неодобрительно относился к затее с сооружением Одессы, Дерибас посоветовал магистрату совершить маленькую хитрость: от имени всех одесситов прислать ко двору «апельсиновых фруктов самого лучшего сорта три тысячи».
В северном Петербурге апельсины тогда считались большой диковинкой. Император смилостивился, и велел выдать кредит…
Адмирал Иосиф Дерибас неожиданно скончался 2 декабря 1800 года в Петербурге в полном расцвете сил.
Он так и не увидел больше своей Одессы.
В столице ему устроили торжественные похороны. Его прах покоится на Смоленском кладбище.
