Впервые старинное село Ильинское на Кубани (село названо по имени церкви св.пророка Илии и реки Кубани), бывшее тогда поместьем Ивана Степановича и Степана Степановича Аргамаковых и «немцев» Ариста Семёновича, Андрея Семёновича и Владимира Семёновича Фамендиных (фон Менгден), упоминается в 1627 году. Церковь во имя св. прор. Илии впервые упоминается в 1628 г., когда сообщается о том, что она сгорела, но вскоре её восстановили. В 90-е годы 18 века взамен деревянного на средства местных помещиков Марии Ивановны фон Менгден и её сына гвардии прапорщика Владимира фон Менгден был возведён каменный одноглавый храм, освящённый в 1796 году. Из деревянной церкви в него перенесли два престола: 1) в холодном четверике — во имя св. прор. Илии, 2) в тёплой трапезной — во имя свт. Николы. Храм был закрыт в 1937 году.
9 сентября 1965 г. по предложению Костромского райисполкома облисполком разрешил снести заброшенный храм и вскоре его разобрали до основания. В сер. 1990-х годов местные жители решили построить на прежнем фундаменте небольшой одноглавый деревянный храм, обложенный кирпичом, во имя св. прор. Илии. Летом 2001 года храм как подворье был приписан к Ипатиевскому монастырю и 2 августа 2001 г. первую Божественную литургию в нём совершил тогда ещё наместник обители архим. Павел (Фокин) с братиями Ипатиевского монастыря… Из статьи Н.А. Зонтикова «Храмы Костромского района»
Ильинская церковь села Ильинского на Кубани каменная, с такою же колокольнею. Построена в 1796 г. усердием г. фон Менгден. В 1908 г. теплый придел расширен в левую сторону. Обнесена каменной оградой, покрытой железом; внутри ограды кладбище без особой церкви.
Престолов два: в настоящей холодной – во имя св. пророка Илии, в приделе теплом – во имя святит. Николая. Часовен в приходе две: одна каменная в деревне Ивакине, другая деревянная в деревне Фатьянке, но без продажи свечей и масла.
Причт состоит из священника и псаломщика. Казенного жалования священник получает 294 руб., псаломщик 98 руб. Общий капитал причта 160 руб. в процентных бумагах. Кружечного дохода получается на долю священника 450 руб., псаломщика – 150 руб. Дом для священника церковный, а у псаломщика собственный; квартирных денег не получается. Земли в пользовании причта усадебной 1050 саж., пахотной 30 дес., сенокосной около 12 дес. в общем владении с крестьянами. План и межевая книга на землю, кроме сенокосной, имеются.
Прихожан муж. пола 642 души, жен. пола 694. Прихожане занимаются земледелием; небольшая часть работает на ткацкой фабрике. Селений в приходе 9, на расстоянии 5 верст от церкви. Имеется при церкви одна церковно-приходская школа.
«Краткие статистические сведения о приходских церквах Костромской епархии». Справочная книга, том 1. Кострома. Губернская типография, 1911 г.