Место для строительства выделил и передал в дар купец Александр Павлович Бабалов. В мае 1903 года была совершена закладка храма на углу Екатерининской и Ирбитской улиц. Проект составил А. И. Ожегов. Церковь была выстроена в 1903–1910 годах, в неорусском стиле. В 1904 году в нижнем этаже был освящён престол во имя преподобного Серафима Саровского. Приход был одним из самых крупных в Перми, доходы храма составляли более 8 тыс. рублей.
Здание на подклете состоит из базиликального трехнефного объема, над восточной частью которого поставлен небольшой пятиглавый четверик, а над западной – шатровая колокольня. Боковые престолы были названы в честь Феодосия Черниговского и Святителей Пермских.
В 1930 году церковь была закрыта и перестроена под хлебозавод. Ещё в конце 1970-х годов городские власти вывели из церкви хлебозавод и начали реставрацию фасадов. Планировалось разместить в здании органный зал. Реставрация, однако, длилась очень долго. В 1991 году церковь была возвращена верующим. Над главным входом в храм был установлен барельеф с ликом Спасителя. В 1996 году церковь была освящена Патриархом. В апреле 2004 года здание храма было дополнено архитектурной подсветкой.
Облик церкви – один из самых известных видов Перми.
