На месте Ильинской церкви в XVII вв. находился Божедомский монастырь, упоминаемый в писцовых книгах 1631 г. С 1788 г. церковь выполняла роль городского собора. В этой церкви в 1758 г. был крещен прп. Серафим Саровский, тут же венчались его родители.
Кирпичная Воскресенско-Ильинская церковь построена в 1768 г. вместо древней деревянной, пришедшей в ветхость. Здание типа восьмерик на четверике с боковыми приделами, трапезной и шатровой колокольней, второй престол Воскресенский.
В 1926 г. церковь закрыли, после чего вплоть до 1995 г. здание использовалось под архивные учреждения. В 1951 г. сломана колокольня, к церкви пристроен Дом книги. В 1995 г. храм передан епархии, отремонтирован.