Первый деревянный храм в честь Воскресения Христова был построен в 1640 году — одновременно с возведением города-крепости Хотмыжск. В то время в храме хранился вызолоченный серебряный крест, подаренный в 1649 году Царём Алексеем Михайловичем в честь победы над неприятелем в сражении под Хотмыжском. К сожалению, это раритет был со временем утрачен. За два столетия хотмыжский храм довольно обветшал и требовал капитального ремонта. К тому времени крепость утратила своё значение, а село превратилось в уездный город. Решено было возвести на этом месте новый, каменный храм.
В 1835 году в уездном городе Хотмыжск Курской губернии было начато строительство трёхпрестольного каменного храма с тем же посвящением по проекту архитектора Авраама Ивановича Мельникова в стиле позднего классицизма. В 1839 году состоялось освящение вновь построенного храма. В дореволюционное время храм имел необыкновенно красивое убранство: 4-ярусный деревянный, резной, позолоченный иконостас, выполненный итальянскими мастерами, а также паникадило и киоты для икон, изготовленные теми же итальянцами.
В 1930-е годы хотмыжский храм был разграблен и закрыт, позже отдан под склад ядохимикатов. В хрущёвские времена (1960-е годы) была полностью снесена колокольня с великолепной колоннадой.
К середине 1990-х годов в селе была образована православная община. В 1995 году было принято решение о восстановлении осквернённого храма. 28 сентября 1996 года храм посетил Святейший патриарх Московский и всея Руси Алексий II. Во время своего визита он освятил Колокол Единения славянских народов, установленный на колокольне храма, а также подарил храму Казанскую икону Божией Матери. С 1997 года в Хотмыжске раз в два года в сентябре молебном в Воскресенском храме открывается Международный фестиваль славянской культуры и искусств «Хотмыжская осень», в которой принимают участие делегации приграничных областей России, Украины и Белоруссии.
