Архиерейское подворье храма в честь святых равноапостольных Кирилла и Мефодия освящено 23 мая 2015 года митрополитом Нижегородским и Арзамасским Георгием. Освящение храма совершено накануне празднования дня их памяти и Дня славянской письменности и культуры, отмечаемых 24 мая.
До революции 1917 года здание с домовой церковью на улице Грузинской принадлежало братству святых равноапостольных Кирилла и Мефодия. В нем располагалось общежитие для бедных учеников губернской гимназии.
Закладка общежития с церковью состоялась в 1894 году. Строительство велось на средства купцов Рукавишниковых. Освящение храма 2 февраля 1897 года совершил епископ Нижегородский и Арзамасский Владимир II Никольский.
Каждый год 24 мая, в день памяти святых Кирилла и Мефодия, в храме проходили чтения, посвященные деяниям Солунских братьев.
В советский период, с конца 1939 года, в здании братства открыли институт микробиологии. Помещение храма было разделено на две части межэтажной перегородкой. В образовавшемся пространстве под куполом разместилась научная библиотека института, а в нижней части была оборудована лаборатория.
В годы Великой Отечественной войны на институт легла большая нагрузка по обеспечению вакцинами Красной армии и гражданского населения СССР. Непосредственно в молельном помещении храма производились вакцины, с помощью которых удалось спасти сотни тысяч жизней.
В апреле 2013 года НИИ эпидемиологии и микробиологии переехал в новое здание на улице Малой Ямской. После этого начались работы по восстановлению храма.