Церковь Марии-Магдалины является домовым храмом, в котором проводятся службы и молятся только обитатели монастыря. Представляет собой небольшое каменное сооружение в один четверик с шатровым завершением и крестом, установленным на каменном глухом барабане.
Сейчас идет реконструкция здания. К основному объему пристроен притвор и оформляется вход. Здание построено из природного камня. Церковь Марии-Магдалины расположена около монастырской стены рядом с Покровской церковью.