Храм святителя Николая в селе Нижние Пены построен в 1867 году, отреставрирован в 2011-2013 годах к 100- летию прославления святителя Иоасафа, епископа Белгородского чудотворца.
В 1930-е годы Никольская церковь в селе Нижние Пены была частично разрушена: пострадали купол и колокольня. Долгое время здание церкви использовалось как зернохранилище, позднее оно было реконструировано под сельский Дом культуры.
С августа 2001 года в селе Нижние Пены действует православный приход Святителя Николая.
3 августа 2013 года митрополит Белгородский и Старооскольский Иоанн и епископ Губкинский и Грайворонский Софроний совершили чин освящения отреставрированного Свято-Никольского храма села Нижние Пены Ракитянского района и Божественную литургию в нем.
В храме пребывает частица мощей хозевитских мучеников, подвизавшихся в обители святого Саввы и убиенных сарацинами в VIII веке. Святыня привезена из Иерусалима.
