Храм святителя Николая в селе Купино построен в 2001 году на метсе разрушенной в 1960-е годы деревянной Георгиевской церкви XVIII века.
История храма Святителя Николая Чудотворца села Купино неразрывно связана с церковью великомученика Георгия Победоносца села Репное. В XVIII веке была построена деревянная Георгиевская церковь, которая просуществовала до 60-х годов XX века. На месте разрушенного храма был построен клуб.
Возрождение храма началось в 1994 году, когда Церкви было передано здание клуба. В возрожденном Георгиевском храме Богослужения проводились до 2001 года.
В 2000 году архиепископом Белгородским и Старооскольским Иоанном было освящено место под строительство нового храма в селе Купино. Храм во имя Святителя Николая построен в двух километрах от старого и освящен архиепископом Белгородским и Старооскольским Иоанном 16 декабря 2001 года. При храме действует детская воскресная школа.