Храм во имя пророка Божия Илии с пределами во имя святителя Николая Чудотворца Мир Ликийских и во имя святителя Митрофания Воронежского была заложена в 1775 году. В народе церковь называют «Николо-Песковской» или «Никола на Песках».
Через год был возведен предел во имя святого Николая Чудотворца. Церковь получила свое название по песчаной почве в этой части города. Главная церковь во имя святого пророка Илии была освящена в 1790 году. Существующие трапезная и колокольня построены в середине XIX века после большого пожара 1858 года, в котором церковь сильно пострадала.
В 1874 году был установлен новый иконостас, в конце столетия церковь обнесли оградой. Храм был закрыт в 30-е годы. После войны в нем размещалась швейная фабрика. В 1995 году здание церкви возвращено верующим, и в этом же году стали проводиться регулярные богослужения. Настоящий адрес церкви: ул. Нормандия-Неман, 73 а (бывшая Николо-Песковская ул.).
