В 1993 году под руководством духовенства Острогожского благочиния Воронежской Епархии стали производиться работы по расчистке пещер, а в 1997 году был официально открыт Спасский женский епархиальный монастырь. В настоящее время на его территории восстановлены пещерные храмы, в которых совершаются богослужения, построены наземный храм Божией Матери «Взыскание погибших», жилые и хозяйственные корпуса.
Единственный наземный храм Спасского монастыря построен в 2000 году и освящен в честь иконы Божией Матери «Взыскание погибших». Одноглавая постройка с трапезной. Здесь проходят богослужения в зимнее время, а во время паломничества можно заказать требы: молебен, сорокоуст, панихиду, неусыпаемую псалтирь.
В этом храме сейчас находится чудотворная «Костомаровская» икона Пресвятой Богородицы, которая была перенесена сюда из пещерного Спасского храма. Размером она в человеческий рост и написана на листе железа Василием Шокоревым во второй половине 19-го — начале 20-го века. На иконе остались следы от шести пуль, выпущенных красноармейцами.