Петр Иванович Щукин – крупнейший коллекционер России второй половины XIX века. Он потомственный почетный гражданин,действительный статский советник, купец, меценат и создатель частного музея «Российских древностей».
В 1891 г. П.И.Щукин купил участок земли на Малой Грузинской улице. Через год архитектор Б.В.Фрейденберг возвел «сказочный терем», в котором коллекционер расположил свое собрание. Коллекция прославилась своей многогранностью. В ней были представлены оружие, ткани, ковры, картины, гравюры, церковная утварь, посуда и драгоценности. Отдельно выделялась библиотека. С 1895 года частный музей стал открыт для свободного посещения. Петр Иванович сам давал пояснения и комментарии к экспонатам. Примечательно также то, что здесь работали над своими произведениями известнейшие художники – А. Васнецов, В. Серов, В.Суриков. Многие элементы внутреннего убранства и внешнего декора были скопированы с памятников русской архитектуры XVII века.
В 1905 г. П.И. Щукин пожертвовал свою коллекцию вместе с землей и недвижимым имуществом Историческому музею. Теперь усадьба стала частью Императорского Российского Исторического Музея им. императора Александра III — Музеем П.И.Щукина. На момент передачи коллекция превышала все фонды Исторического музея. Бывший владелец до конца жизни оставался хранителем собрания, пополнял коллекцию и издавал описи ее отдельных частей. В 1912 г. после смерти П.И.Щукина музей прекратил свое существование, коллекции постепенно перевезли в Исторический музей.
С 1923 по 1924 г.г. в комплексе зданий хранились фонды Музея Старой Москвы, затем размещался Музей Центральной Промышленности области. В 1928 г. по злому року судьбы усадьба передается для размещения студенческого общежития. В 1934 г. два здания усадьбы из трех вновь приняли в свои стены Государственный Биологический музей им. К.А.Тимирязева. Лишь в 1995 г. музейному комплексу присваивается статус памятника градостроительства и архитектуры федерального значения.