Горненский женский монастырь основали неподалеку от Иудова града, где проживали родители святого Иоанна Предтечи. Участок земли для будущего монастыря купил глава Русской духовной миссии архимандрит Антонин (Капустин). Хотя первые паломники и монахини стали селиться здесь еще в 1871 году, первый храм Казанской иконы Божией Матери построили только через десять лет. Статус монастыря обитель получила в 1898 году.
Так как местные монахини происходили из знатных и богатых родов, то для них построили не один большой сестринский корпус, а отдельные домики. Правда, за их же счет. Всего к 1914 году в монастыре проживало 200 насельниц, которые трудились в иконописной и золотошвейной мастерских. В 1947 году в ходе Арабо-израильской войны монастырь сильно пострадал, поэтому монахини уехали в Палестину. И только часть насельниц вернулась в храм в 1948 году.
За последние 30 лет в монастыре открыли новый пещерный храм в честь святого Иоанна Предтечи и собор во имя Всех святых в земле Российской Просиявших. Сегодня в обители проживают более 60 монахинь.