Геленджикский историко-краеведческий музей был основан в 1909 году как «Естественно-научный музей». Начало музею положили археологические коллекции профессора В.Б. Саханева, которые помещались в сторожке Михаила Михайловича Рейнке.
Сегодня музей является хранителем материальной и духовной культуры города и курорта. Геленджик известен своими уникальными природно-климатическими факторами, богатством растительного и животного мира – все эти особенности отражены в музейных коллекциях: горных пород, насекомых, птиц, животных и обитателей Черного моря. Музей располагает также интересными археологическими коллекциями: дольменной культуры III-II тысячелетия до н.э.; античности – VI-V вв. до н.э. (на берегу нашей бухты находилось древнегреческое поселение Торик), которые приобщают наш курорт к мировой цивилизации. Эпоха средневековья познакомит с яркой и самобытной местной адыгской культурой. Кавказская война представлена экспонатами, напоминающими о событиях, которые происходили в Геленджикском укреплении, основанном в 1831 году, включая макет укрепления, изготовленный известным российским художником Александром Завалием. Коллекция мебели конца XIX – начала XX века представляет быт дачников этого периода.
Музей имеет филиалы: Батарея № 394 капитана А.Э.Зубкова на федеральной трассе М-4 «Дон» между г. Новороссийск и с. Кабардинка и Дом-музей В.Г. Короленко в хуторе Джанхот