В 1793 году закончил Петербургское горное училище. В чине шихтмейстера поступил на Колывано-Воскресенские Алтайские заводы, служил «по маркшейдерской должности и заведованию лесов» на Змеиногорском, а затем на Гольцовском, Семеновском, Лазурском и 8-м рудниках. В 1797 году заведовал припасами на Сузунском медиплавильный заводе. С 1798 года по 1801 год руководил поставкой свинца с Нерчинских на Колывано-Воскресенские заводы.
С 1801 года маркшейдер, затем форстмейстер при Барнаульской чертёжной. В 1804—1805 годах составил карты Иртыша и его притоков. В 1806—1807 годах вносил предложение о постройке конных рельсовых путей заводского назначения общей длиной более 150 км, а также сети водных путей сообщения, однако проекты приняты не были. В 1806 году представил горному ведомству разработанный им проект чугунной дороги от Змеиногорского рудника до Корбалихинского сереброплавильного завода. Выгода была настолько очевидна, что в этом же году проект был утверждён. В эксплуатацию дорога длиной около 2 км — первая в России чугунная дорога с конной тягой — была сдана в 1809 году и функционировала более 25 лет. В 1808 году руководил постройкой судов собственного изобретения и опытным сплавом на них руд в Барнаул по Алею и Оби. В 1808—1809 году проделал большую работу по упорядочению казённой библиотеки.
С 1811 года назначен начальником чертёжной департамента горных и соляных дел в Петербурге. В этот период:
— в 1812 году исследовал устье Камы для определения возможности постройки здесь соляных магазинов;
— в 1812—1813 годах изучал варианты доставки соли с озера Эльтон на Волгу при помощи канала или «чугунной дороги», составив первый проект такой дороги, который, однако, реализован не был;
— в 1814 году проводил инспекцию Старорусского солеваренного завода для изыскания средств к его восстановлению;
— в 1815 году исследовал причины ропота крестьян на Белорецких заводах Пашкова.
В 1817 году назначен начальником округа Колывано-Воскресенских заводов, а в 1822 году одновременно и Томским гражданским губернатором. При его содействии и по его инициативе:
— в 1819 году введены доменное и железное производства на Гурьевском заводе;
прекращена плавка серебра на Сузунском заводе, завод остался только медеплавильным;
— увеличена чеканка монеты с 250 до 350 тысяч рублей в год;
— увеличена выплавка железа и чугуна, а выплавка свинца увеличена настолько, что с 1824 года по 1830 год не требовалась его поставка из Нерчинского завода;
— производство серебра стабилизировалось на уровне 1000 пудов в год;
— Высочайшим указом 22 июня 1822 года управление приписными крестьянами выделено из ведения горного начальства и передано особым управителям, что давало приписным крестьянам некоторую возможность обжалования действий горного начальства;
— Высочайшим указом 16 апреля 1828 года утверждено учреждение об управлении заводов и положение о мастеровых и приписных к заводам крестьянах, в соответствии с которым мастеровые стали получать бесплатный провиант;
— построены первые в Западной Сибири бумажная фабрика и типография;
основаны метеорологическая и магнитная станции;
— в Барнауле началось строительство горного госпиталя, училища и богадельни с церковью, обелиска в честь 100-летия горного дела на Алтае, этот архитектурный ансамбль позже стали называть «уголком Петербурга»;
— в 1823 году основан Краеведческий музей, совместно с доктором Ф. А. Геблером, для которого по его приказу были изготовлены 43 модели станков, машин, механизмов, в том числе модель «огненной машины» И. И. Ползунова;
— в Барнауле на Московском переулке появился первый бульвар.
В 1830 года Пётр Козьмич вышел в отставку в чине обер-берггауптмана 4 класса и уехал в Петербург.
В 1831 году вновь поступил на службу с производством в тайные советники и назначен сенатором. Вместе с сенаторами Б. Я. Княжниным, Кочубеем и князем Голицыным с 1837 года — член временного совета по управлению государственным имуществом. Кроме того, председательствовал в комиссии при департаменте государственных имуществ по выяснению дел о конфискованных имениях. С 26 декабря 1837 года, с учреждением министерства государственных имуществ, назначен членом совета министерства. Одновременно состоял членом особого присутствия при 1-м департаменте Сената для рассмотрения проекта откупных условий, в 1838 году — председателем комиссии для устройства управления государственными имуществами в западных губерниях, а в 1839—1843 годах членом присутствия Сената по производству торгов на питейные откупа.
Известный собиратель и знаток старинных русских книг, картин, других произведений искусства. Часть коллекций подарил музею, казённой библиотеке, а также Димитриевской церкви, картины религиозного содержания, Императорской публичной библиотеке.
Скончался в 1839 году. Похоронен на Тихвинском кладбище Александро-Невской лавры.