На месте возрожденной церкви стоял собор, построенный в 1857-1868 гг. по проекту известного петербургского архитектора Г. А. Боссе. Храм был каменный, пятиглавый, трехпрестольный в честь Казанской иконы Божией матери с четырехъярусной надпапертной колокольней, освященный 9 сентября 1868 г архиепископом Вятским Аполлосом (Беляевым). Приделы были освящены в честь Иоанна Предтечи и св. Параскевы Пятницы.
В 1918 г. монастырь был официально закрыт. Община Казанско-Богородицкой церкви в 1928-1929 гг. неоднократно обращалась в Елабужский горсовет с просьбой вернуть ей храм, однако в 1930 году собор Казанской иконы Божией Матери была разрушен.
Большое событие в жизни возрожденного монастыря произошло 31 октября 2012 г., когда митрополитом Казанским и Татарстанским Анастасием был торжественно освящен вновь отстроенный главный храм обители – во имя Казанской иконы Божией Матери.
По материалам книги: А. Елдашев «Игуменья Маргарита Мензелинская» — издат. дом «Логос», Казань-2013 г.