Покушение осуществила петербургская организация «Союза социалистов-революционеров максималистов», образовавшаяся в начале 1906 года. Столыпин вызывал ненависть революционной части общества жестоким подавлениям революционного движения. Организатором был Михаил Соколов («Медведь», «Анатолий», «Пётр Васильевич»).
12 августа (по старому стилю), суббота — был приёмный день Столыпина на казённой даче на Аптекарском острове в Санкт-Петербурге. Приём начался в 14.00. Около половины третьего к даче подъехал экипаж («ландо»), из которого вышли двое в жандармской форме с портфелями в руках. В первой приёмной, столкнувшись с генералом А. Н. Замятниным, ведшим запись на приём, террористы бросили к следующим дверям портфели и бросились прочь. Раздался взрыв большой силы, пострадали более 100 человек: 27 человек погибли на месте, 33 — тяжело ранены, многие потом скончались.
Пострадали двое детей Петра Аркадьевича (находившиеся на балконе) — двенадцатилетняя дочь Наташа (были сломаны обе ноги) и трёхлетний сын Аркадий.
Сам премьер и находящиеся в кабинете посетители получили ушибы (была сорвана с петель дверь).
После взрыва Столыпин ни на секунду не потерял самообладания и выдержки, что впоследствии имело важное значение. Со слов В. Н. Коковцова, произошла резкая «перемена в отношении к нему не только двора, широких кругов петербургского общества, но и всего состава Совета Министров, и, в особенности, его ближайшего окружения по Министерству внутренних дел…». Укрепилось его положение и у трона.
1 сентября (19 августа) были введены военно-полевые суды для ускоренного рассмотрения дел террористов революционеров. Но это привело только к ожесточению революционной борьбы.
На месте теракта был разбит цветник. В 1908 году на месте взрыва был возведён гранитный обелиск, спроектированный архитектором Робертом Марфельдом. Первый камень был заложен 12 августа 1907 лично Петром Аркадьевичем Столыпиным. В 2006 году памятник был отреставрирован
