Церковь святых Захарии и Елисаветы — первая каменная постройка Свято-Троицкого Клименецкого монастыря и, вероятно, старейшее сооружение из камня на всем Большом Клименецком острове. Церковь была возведена в 1757 году на средства, пожертвованные монастырю императрицей Елизаветой Петровной, причем есть все основания полагать, что строила храм артель крестьянских мастеров, незнакомая с широко распространенным тогда в больших городах стилем барокко. Архитектурные формы здания довольно архаичны — оно представляет собой простой четверик с притвором и четырехугольной апсидой, крыша четырехскатная, завершенная одной главкой. Внешний декор достаточно скромный и представлен лишь столпами-лопатками на боковых стенах и бегунком по апсиде в виде полосы положенного углом кирпича.
В 1840 году церковь была подвергнута незначительной перестройке, в 1906 году была повреждена пожаром, но уцелела, в отличие от большинства других монастырских построек.
В 1920-е годы церковь была закрыта вместе с самим Климецким монастырем, а в послевоенные годы приспособлена под проживание персонала пионерского лагеря, разместившегося в бывших постройках обители.
В настоящее время, после закрытия лагеря, территория урочища Клименицы пришла в полное запустение. Церковь Захарии и Елисаветы, по неподтвержденным данным, по-прежнему периодически используется как жилое помещение. Второй этаж здания частично остеклен и утеплен, обустроена печь с выходом через пробитый купол. Нижняя половина бывшей церкви находится в гораздо более тяжелом состоянии. При входе в храм в полу оборудован ледник-яма, при его строительстве были обнаружены человеческие останки, захороненные здесь после уничтожения монастырского кладбища в советские годы. Частично расчищено от завалов основное помещение храма, в том числе пол левого клироса, где, по преданию, покоятся мощи основателя монастыря Ионы Климецкого. На стенах алтаря на первом этаже сохранились фрагменты фресок, которые, по-видимому, пытались сбить при переоборудовании здания; сегодня остатки настенной живописи постепенно разрушаются, так как находятся во влажном не застекленном помещении. Вызывает опасения и состояние самого здания: кирпич постепенно выветривается и крошится, штукатурка не сохранилась, из-за отсутствия крыши своды здания близки к обрушению.
