Первое письменное упоминание о Зашугомье встречается в дозорной книге Соли Галицкой от 1613 года, где сказано: «Погост — а на нем храм Живоначальной Троицы вверх шатром, да другой храм Чудотворца Николая клецки с трапезою а в них образы, и книги, и ризы, и свечи, и сосуды церковные, и колокола строение все мирское и на том же погосте двор пономаря Третячки Микитина, двор просвирницы Маланицы. Да тут же на погосте 4 крестьянских двора. Да деревни Коробкино, Колесниково, Муравьево, Сергоцкая, Слезино. Деревня Самылково а крестьяне все побиты а иные разбрелись». Дозор Солигалича и погостов был проведен дьяком Кузьминым по приказу царя Михаила Федоровича в 1614 году с целью установить размеры разорения, причиненного Солигаличу и посадам польско-литовскими интервентами. Следовательно, от набегов интервентов и Зашугомье в стороне не осталось.
В 1622 году царем Михаилом Федоровичем зашугомские земли были даны в вотчину Михаилу Шейну — воеводе, руководящему защитой Смоленска во время войны России с Польшей, но сдавшему город полякам и за это казненному. Троицкая вотчина была передана Якову Дашкову, сын которого В.Я. Дашков был русским посланником в Англии. А в 1770 году село Троицкое-Зашугомье с прилегающими деревнями Коротково, Бородавицыно, Рылово, Колесниково и др. принадлежали князю П.И. Мещерскому, от которого по наследству перешли к графу Петру Александровичу Румянцеву, сподвижнику Екатерины II, фельдмаршалу, получившему за свои военные заслуги приставку к фамилии: Задунайский.
Административно-религиозным центром волости был Троицкий погост в Зашугомье, называвшийся по имени стоявшей здесь церкви Троицы. На погосте было две деревянных церкви — Живоначальной Троицы и Николая чудотворца, по ветхости неоднократно перестраивавшиеся. В 1653 году к Троицкой церкви были приписаны два двора попов, двор дьячков, двор пономаря, двор просвирницы, два двора бобылей, 12 четей пашенной земли, 30 копен сена. Кроме того, в приходе церкви имелись три помещичьих двора, 140 крестьянских дворов, 128 дворов бобылей, 9 дворов вдовьих.
В 1685 году патриархом дано разрешение построить в Троицком погосте каменную церковь Покрова Пресвятой Богородицы с приделом Николая чудотворца, и в 1703 году эту церковь освятил игумен Воскресенского монастыря Соли Галицкой Киприан. Дальнейшая судьба этого храма неизвестна.
В 1704 году была построена и освящена новая церковь Живоначальной Троицы с приделом Происхождения Честного Креста. Два антиминса в патриаршем казенном приказе получил поп Троицкой церкви Дмитрий.
В 1720 году службу в погосте Троицком вели попы Лев Дмитриев и Матвей Дмитриев, а в 1723 году – поп Петр Дмитриев, дьяконы Григорий Васильев, Петр Григорьев, пономари Иван Дмитриев и Алексей Григорьев, дьячки Алексей Дмитриев и Матвей Космин. В 1733 году вместо умершего дьякона церкви Григория Васильева, назначили его сына Алексея Григорьева.
В 1800 году на средства помещика Ивана Ивановича Львова и при помощи прихожан в с. Троицкое-Зашугомье была построена новая каменная двухэтажная Троицкая церковь с каменной колокольней. Церковь была обнесена кирпичной оградой — внутри находились кладбище, каменные кельи и кладовая. В приходских селениях располагались девять деревянных часовен.
Троицкая церковь имела пять освященных престолов: в летнем приделе во имя Животворящей Троицы, во имя Покрова Пресвятой Богородицы; в зимнем приделе в честь Богоявления Господня, в честь святого пророка Илии, в честь преподобного Макария Унженского.