В 1663-1664 годах на месте Троицкой церкви был срублен деревянный храм. Из-за малых размеров деревянный храм был разобран и на его месте возведена церковь Благовещения, так-же деревянная. Позднее и она была разобрана и в 1778 году была заложена одноэтажная каменная церковь Троицы. Процесс возведения Троицкой церкви распадается на два строительных периода – 1778-1790 годов и 1803-1806 годов. Строительство церкви велось артелью енисейских мастеровых при участии монастырской братии Туруханского монастыря и жителей Туруханского округа. За продолжительный строительный период в работах по возведению и оборудованию здания Троицкой церкви принимало участие множество людей.
Особенностью объемно-пространственной композиции Троицкой церкви является размещение между притворами холодной и теплой церквей помещения церковной ризницы, отчего столп колокольни оказался сдвинутым к югу от продольной оси холодного храма. К основному ядру здания – квадратному четверику холодного храма примыкают помещения алтаря и трапезной, перекрытые коробовыми сводами с лотками и надоконными распалубками.
С запада расположено квадратное в плане помещение притвора с крестовым сводом. Помещения храмовой части и трапезной теплого придела пространственно слиты и перекрыты коробовым сводом с лотком и надоконными распалубками, имеющими в храме и трапезной различную высоту. Алтарь придела также перекрыт коробовым сводом с распалубками и лотком. Свод в помещении притвора теплого придела коробовый. Помещение церковной ризницы, освещенное одним окном, перекрывалось сводом.
Пространство трехсветного четверика «холодного» храма перекрывалось восьмигранным сомкнутым сводом, имевшим крутую стрелу подъема при низкой закладке пят. В 1882 году все крыши здания были покрыты железом и окрашены в зеленый цвет. В результате проведенного в 1900-1901 годах капитального ремонта церкви в окраске покрытий здания произошли изменения: купола на храме и колокольне, шпиль, а также «зонты» были выкрашены «медянкой»; главы – ультрамарином с накладкой на них «жестяных, вызолоченных двойником звезд», кресты на обоих храмах и колокольне вновь вызолотили листовым золотом. Первый раз кресты были вызолочены «одинарным» золотом еще в 1858 году.
К моменту окончания строительства здание имело размеры в плане 27,06м х 16,02м и по высоте храмовой части вместе с центральной главой и крестом 23,9 м. Колокольня со шпилем и крестом были высотой 31,05 м.
Сохранился только первый этаж, перекрытый деревянным перекрытием, новой кровлей. Фундаменты выложены из бутового камня, ленточные глубиной заложения от 2.70 м от уровня пола 1-го этажа. Стены здания сложены из хорошо обожженного красного кирпича размером 28х13х6 см на известковом растворе крестовой системой, толщина стен — 132 см. Стены оштукатурены и побелены изнутри и снаружи. Наружная поверхность стен имеет незначительные утраты. Над оконными и дверными проемами имеются трещины. Перекрытия сводчатое кирпичное в притворе и ризнице. Сохранились крестовые своды алтаря. Своды в Троицком приделе, притворе Благовещенского придела — утрачены. В настоящее время утрачены второй и третий ярус колокольни, а также второй свет четверика храма с завершениями. Декоративное оформление наличников окон сохранилось удовлетворительно, имеются утраты отдельных элементов. Исторические оконные заполнения и деревянные дощатые ставни, утрачены полностью, имеются лишь металлические навесы. В окнах имеются форточки. Металлические решетки кубоватого рисунка сохранились подлинные. Полы трапезной и Троицкого придела покрыты керамической плиткой. В алтарной части и Благовещенском приделе полы дощатые деревянные.
Деревянная лестница на колокольню не сохранилась. Первоначально сообщение между первым и вторым ярусами колокольни осуществлялось по лестнице внутри стены. Она располагалась в толще северной стены притвора «холодного» храма и имела крутой подъем. Лестница освещалась через ныне заложенное квадратное отверстие в массиве стенной лопатки западного фасада, отверстие видно на старинных фотоснимках.
Входная зона расположена с западного фасада через притвор в колокольне. В этом притворе находится вход в храм и церковный киоск. Благовещенский теплый и Троицкий холодный придел соединены между собой дверным проемом. Объем Троицкого придела объединен с алтарной частью через большой арочный проём. Алтарные объемы соединены между собой дверным проемом. В каждом приделе имеются деревянные иконостасы.
Территория церкви огорожена деревянным забором. Состояние удовлетворительное. Хозяйственные деревянные постройки и туалет отсутствуют. Здание церкви не имеет сетей канализации и центрального отопления. Водопровод отсутствует. Освещение электрическое.
Утрачены свод церковной ризницы, уничтожена колокольня со шпилем и крестом, полностью утрачена центральная глава с крестом, утрачен трехсветный четверик холодного храма.
В 2008 году проектным бюро Разваляева Е.О. был разработан проект Реставрации и воссоздания памятника культурного наследия «Соборная церковь Троицкого монастыря» XVIII века. В 2009 году на выставке Строительство и архитектура проект получил 1 место в конкурсе проектов «Ордер воплощения».
