Храм этот, теперь не существующий, находился недалеко от Спасо-Преображенского монастыря на перекрёстке улиц Эспланадной и Смоленской. История его появления уходит глубиною в XVII век, когда территория Белого города стала приобретать черты густонаселённого посада. Если в западной его части била кругом торговая жизнь, а в центральной и южной разместились стрельцы, то северо-восточный его угол по-прежнему оставался малообжитым. Только в начале 70-х годов здесь, на территории между Спасо-Преображенским и Вознесенским монастырями, была основана слобода рыбных ловцов. Место было удобное, рядом располагались Косые, или Исадные, ворота Белого города, выходившие прямо на реку Кутум, бывшую тогда судоходной, а вдоль берега её тянулся богатый астраханский рынок Исады, где рыбаки могли сразу же продать свой улов. Слобода расстраивалась и процветала. Вскоре после основания рыбацкой слободы появились и первые упоминания о Смоленской церкви. Её появление было связано с основанием нового прихода, в который вошли жители новой слободы. Ими же, возможно, и была построена первая деревянная церковь.
Назван был храм в честь иконы Божией Матери, именуемой Смоленской или иначе «Одигитрией», то есть «Путеводительницей». Эта икона покровительствовала путешествующим или по морю плавающим, в том числе и рыбакам, отдавшим себя под её покровительство. К тому же появление здесь храма с таким названием могло быть объяснимо появлением в Астрахани явленного списка с чудотворной Смоленской иконы Божией Матери. Точная дата явления этого списка, тоже прославившегося чудотворениями, была неизвестна, но он хранился, как великая святыня, в храме с первых дней его существования.
В 1728 году астраханский купец Фёдор Черпаков просит разрешения у Астраханского епископа Варлаама Леницкого на строительство новой каменной Смоленской церкви. 19 января 1728 года ему дана была храмоздательная грамота, а к 1737 году строительство было уже завершено.
10 ноября 1737 года новосооружённый храм был освящён епископом Иларионом.
В 1923 году Смоленская церковь была захвачена обновленцами. В 1928 году состоялось заседание Президиума окрисполкома по вопросу о ликвидации действующей церкви Смоленской Божией Матери по ул. Трусова, 60. Здание церкви было признано обветшавшим, требующим значительного ремонта с устранением грунтовых вод и исправлением наружной кладки. По просьбе церковной общины живоцерковников-обновленцев, не располагавших средствами для её ремонта и содержания, Смоленская церковь была закрыта. Здание и имущество церкви переданы в Госфонд. 5 января 1930 года особая часть Госфонда округа сообщила в Астраханский совет народного хозяйства, что ею было продано ГОККО здание бывшей Смоленской церкви под снос. В том же году храм был снесён. Сейчас на этом месте находится двухэтажный жилой дом на углу улиц Трусова и Шелгунова, 30/10.