В 1727 году епархиальным начальством было велено вместо деревянной церкви в Усть-Суерской слободе возвести каменную, а в д. Шмаковой устроить деревянную. Между 1727 и 1743 годами была срублена деревянная Покровская церковь, сгоревшая в конце 1749 года или в начале 1750 года. В 1751 году построена новая деревянная однопрестольная церковь. Впоследствии здание обветшало и 23 февраля 1827 года были выданы утвержденные план и фасад нового каменного храма. В нем решено было устроить два престола: в главной холодной церкви — в честь Покрова Пресвятой Богородицы, в теплом зимнем приделе — в честь Вознесения Господня. Храм заложен 15 августа 1827 года. В теплом Вознесенском приделе богослужения начали совершаться с 1833 года, главный престол в холодной Покровской церкви из-за неготовности иконостаса был освящен только к 1835 году. К 1850 году храм был обнесен кирпичной с деревянными решетками оградой, на западных углах которой были выстроены каменные училище и лавка для продажи свеч. В 1865 и 1868 годах ограда пострадала от весенних разливов реки Суери.
В храме была икона Божией Матери «Достойно есть», выписанная из Афонского Андреевского скита по почину настоятеля протоиерея Григория Рещикова с разрешения епархиального начальства. Образ был освящен в 1892 году на Святой горе Афон с положением в него по благословению епископа Тобольского и Сибирского Иустина частиц мощей Святого Великомученика Пантелеимона и Преподобного Иоанна Кукузеля. Ежегодно в день празднования иконы, совершаемого 11 июня по старому стилю, проводился крестный ход с ней вокруг села, а потом по дворам всех прихожан. Последняя из членов общины Елизавета Андреевна Рухлова в 2003 году передала образ в Успенский храм пгт Варгаши.
Во время восстания 1921 года восставшие заперли местных членов Союза молодежи в помещении колокольни, после чего подожгли её. В 1922 году властями была изъята из Шмаковской церкви серебряная украшенная камнями риза с одного из образов, простреленная в нескольких местах пулями. В 1925 году в храме находились два деревянных иконостаса, в одном из которых помещалось 15 икон, а на колокольне имелись 6 колоколов. Звон их был запрещен постановлением президиума Белозерского райисполкома от 7 декабря 1934 года, но церковь ещё действовала, при ней имелся священник.
В 1938 году решениями общегражданских собраний жителей населенных пунктов Шмаковского и Шастовского сельсоветов церковь была закрыта и с этого времени использовалась для хранения зерна, а к 1945 году одна половина её была переоборудована под клуб. К 1958 году здание стало непригодным к использованию даже под складское помещение: штукатурка внутри и снаружи обсыпалась, началось выветривание стен, железная кровля обветшала, от попадания осадков перекрытие центрального купола дало трещину и частично обрушилось. В 1959 году Курганский облисполком принял решение о разборке здания бывшей церкви на стройматериалы, которое не было исполнено. В 2008 году здание вошло в список выявленных объектов культурного наследия Курганской области.
Приход Покрова Пресвятой Богородицы с. Шмакова Варгашинского района был зарегистрирован 18 марта 1996 года. В конце 1990-х годов члены общины собирались для молитвы в частном доме, затем – в приспособленном помещении. Но со смертью стариков община становилась все малочисленнее и в 2007 году Покровский приход официально прекратил свою деятельность как юридическое лицо.
