Однокупольный каменный храм с колокольней располагается на пригорке, неподалеку от рыночной площади в центре Нежина и отмечает восточную границу городских укреплений XVII века. Храм хорошо просматривается с нескольких улиц и поэтому является важной градостроительной доминантой исторического центра города. Нежин — единственный город в Украине, где сохранилась планировка и застройка XVII-XVIII веков в виде шестиугольной звезды, на концах и пересечениях линий которой были построены 32 церкви, в настоящее время сохранилось 20.
Сама же церковь построена на средства нежинских мещан в честь проведения Покровской ярмарки в Нежине. Строительство храма происходило с 1757-1765 годов и с тех пор церковь не перестраивалась. В первой трети XIX века перед западным фасадом пристроена двухъярусная колокольня в стиле ампир. Она отличается большим масштабом и тяжелыми пропорциями. Каждый ярус украшен портиками с четырьмя спаренными колоннами тосканского ордера и завершается треугольным фронтоном с карнизом. Хотя в советское время церковь была закрыта и не использовалась по назначению, однако хорошо сохранила аутентичные архитектурные формы. Здание с четко выраженной вертикальной осью и ярусным нарастанием масс к центру. В плане — крест с очень короткими ветвями, к которым по сторонам примыкают четыре экседры. Они выглядят очень массивными и приземистыми. Каждая экседра имеет дверной проем и два больших окна вытянутых пропорций. Основной объем, в отличие от других аналогичных памятников, завершен не треугольными фронтонами, а горизонтальными карнизами. За время правления советской власти, как и многие религиозные строения в тот период, Покровская церковь пережила непростое время.
В 1960 году двери закрылись для прихожан. Церковнослужители были выброшены на улицу, а иконостас, книги и иконы были уничтожены. Возрождение Нежинской святыни началось в 1993 году после передачи здания во владение УПЦ. Повторное освящение было произведено в октябре 2001 года. В настоящее время Покровский храм принадлежит УПЦ Киевского патриархата.