Храм в селе Балтай деревянный двухпрестольный с деревянной же колокольней был построен в 1864 году. В нем был устроен придел во имя святого благоверного великого князя Александра Невского. В штате храма были священник и псаломщик, дома для причта были церковные. При храме были мужская и женская церковно-приходские школы.
В предреволюционные годы храм был перестроен в каменный. К шестикупольному новому храму была пристроена каменная колокольня, высота которой достигала почти семидесяти метров. В конце 1920-х годов храм в селе был уничтожен. Из камней храма первоначально предполагалось построить в селе новые дома, однако кладка оказалась такой прочной, что удалось лишь разломать стены на большие неровные глыбы, непригодные для строительства. Поэтому остатками храмовых стен замостили дорогу, идущую от въезда в Балтай к центру села. На месте разрушенного храма была построена школа, на месте церковного кладбища разбит сквер.
В 1991 году, по благословению Архиепископа Саратовского и Вольского Пимена Хмелевского, в Балтае был образован православный приход. В связи с отсутствием места для совершения богослужений, первоначально службы совершались в фойе действующего кинотеатра, затем приходу было предоставлено для совершения богослужений здание бывшего Дома пионеров.
16 ноября 1997 года, по благословению Архиепископа Саратовского и Вольского Александра Тимофеева, протоиерей Александр Ткачев, благочинный Северо-Западного округа, в сослужении духовенства совершил чин основания строящегося храма.
В 2003 году в селе был возведен каменный храм, престол в котором, также как и в дореволюционном храме, был освящен в честь Покрова Пресвятой Богородицы. 14 октября 2003 года, в день престольного праздника, состоялось первое богослужение. 18 октября 2003 года, по благословению Епископа Саратовского и Вольского Лонгина, совершен чин положения Антиминса.
