Как свидетельствуют исторические документы, построенный при Покровском женском монастыре храм был освящен Преосвященным Иакимом, епископом Оренбургским и Уральским, 24 августа 1908 года. Но в 1925 году был закрыт, затем разрушен и осквернен богоборцами. Долгие годы храм находился в запустении и разорении, а в 1959 году его перестроили под клуб воинской части. После ликвидации воинской части храм вновь подвергся разрушениям и когда в 1994 году его передали Русской Православной Церкви, церковное здание имело весьма плачевный вид.
Первая служба в восстановленном храме состоялась в 1995 году, в канун престольного праздника.
Из воспоминаний настоятеля храма протоиерея Анатолия Сопиги: «В 1994 году митрополит Оренбургский и Бузулукский Леонтий подписал Указ о назначении меня на настоятельское место в храм Покрова Пресвятой Богородицы города Орска. К тому времени территорию монастыря военная часть покинула, и там располагалась милиция. Нам дали 5 пропусков на территорию. Никакой передачи – ни документальной, ни иной – не было. Чтобы как-то узаконить наше пребывание, мы заключили договор аренды на земельный участок, на котором располагались два здания – храм и домик игуменьи. Храм выглядел просто страшно. Не было ни окон, ни дверей, в алтаре располагалась сцена, на сцене – общественный туалет. Над сценой по бокам – макеты красных флагов, в центре – портрет Ленина…».
