Первая церковь в селе Чернокоровское Камышловского уезда Пермской губернии, ныне Богдановичского района Свердловской области, была заложена 29 июня 1800 года. Храм выстроили деревянный. Главный престол освятили во имя апостолов Петра и Павла., а боковой придел – во имя святителя Николая Чудотворца. На колокольне размещалось пять колоколов, самый большой весил 27 пудов.
С течением времени деревянное сооружение обветшало, и жители села решили на свои средства возвести новую каменную церковь. Закладка состоялась 18 августа 1838 года. 18 марта 1843 года произошел пожар, полностью уничтоживший старый деревянный Петро-Павловский храм. К счастью, к этому времени новая церковь уже была окончена сводами и покрыта тесом. Теплый придел во имя Николая Чудотворца освятили 8 января 1844 года. 29 июня 1855 года был освящен главный придел во имя святых апостолов Петра и Павла. Тогда же освятили и новый позолоченный иконостас. Долгое время жители Чернокоровского села вынашивали планы устроить в храме еще один придел во имя святителя Митрофана, но их замыслы так и не осуществились. Церковь стала двухпрестольной.
В 1881 году прихожане Чернокоровской церкви собрали средства на строительство ограды вокруг церкви. Она была сооружена из мраморных столбов железными решетками. В это же время на средства сельчан произведено золочение трех крестов и яблок на церковных главах.
В 1883 году в селе вновь произошел пожар, во время которого сгорел дом священника, после которого батюшка разместился в здании, принадлежащем сельскому обществу, но построенном на церковной земле. Псаломщик же квартировал в церковном доме, построенном на земле сельского общества, в 1901 году этот дом был отремонтирован и реконструирован на средства прихожан.
В 1888 году в селе Чернокоровском начало работать церковно – приходское попечительство, куда поступали пожертвования на благотворительные цели.
По состоянию на 1903 год церковь святых апостолов Петра и Павла села Чернокоровское представляла собой одноэтажное каменное здание с колокольней, обнесенное оградой. Как церковь, так и ограда были в хорошем состоянии, крепкие. Церкви принадлежало несколько деревянных лавок и амбар для хранения зерна, кроме того, имелось три десятины земли усадебной, 9 десятин сенокоса и 90 десятин пашни находилось в пользовании притча, но документально закреплены не были.
В состав Чернокоровского прихода включались деревни Раскатиха и Паршина. Всего прихожан насчитывалось 2440 человек. В деревне Паршина с 1883 года действовала деревянная Николаевская часовня, построенная на деньги жителей. После революции 1917 года и принятия декрета «Об отделении церкви от государства и школы от церкви» в 1918 году началось наступление властей на православную веру. Одним из проявлений этой политики стало изъятие церковных ценностей в 1922 году. 1 июня 1922 года Камышловский уездный финансовый отдел отослал в Екатеринбургский губернский финансовый отдел 10 фунтов 8 золотников серебра из Петро-Павловской церкви села Чернокоровского. На переплавку пошли потир, дарохранительница, четыре напрестольных креста и др. богослужебные предметы.
Начиная с 1928 года, после снятия колоколов, в храме располагался дом культуры, а затем, здание храма использовали под различные колхозные нужды. Из воспоминаний старожилов села как наружная, так и внутренняя часть храма была в хорошем состоянии. С начала 80-ых годов все изменилось. Рядом с храмом, находилось церковное кладбище и на его месте, было решено построить животноводческий комплекс, для которого был необходим кормоцех. Кормоцех расположили в храме. От различных перестроек храм сильно пострадал. Через алтарь в храм заезжали трактора. Пострадала колокольня, которую уменьшили и установили на ней прожектор. В храме были заложены кирпичом окна, пробиты стены, убран полностью пол, на забетонированных блоках было установлено оборудование. Из-за постоянной смены температуры в храме начала разрушаться роспись на стенах и куполе, стал выкрашиваться кирпич. Осквернение храма шло до середины 90-х годов.
В 2007 году были установлены новые оконные рамы, железные двери. Проведены кровельные работы. К концу 2007 года работы по реставрации купола над главным приделом были завершены. В феврале 2008 года по селу прошел Крестный ход, завершившийся установкой креста над церковным куполом.
Затем, уже летом, восстановление было продолжено. Согласно составленному проекту-эскизу начались наружные работы: штукатурка и покраска центрального Петро-Павловского придела, восстановление крыши над Свято-Николаевским приделом, восстановление алтаря. В ноябре 2008 года эти работы были закончены установкой креста на алтарную часть.