Село Лопуховка было основано не позднее второй половины XVIII века при реках Медведица и Иткарка. По престолу местного храма, построенного в 1817 году, село также называлось Никольским. Здание каменное, с каменной же колокольней, строилось тщанием помещика Кинешского. Придел в храме был освящён во имя святых и праведных Симеона Богоприимца и Анны Пророчицы. Дома для священника и псаломщика были церковные. Последним владельцем села был помещик Юрьевич. В составе Аткарского уезда Саратовской губернии Лопуховка являлась волостным центром. В 1910 году в селе насчитывалось 166 хозяйств и 1006 жителей. Имелись земская школа и фельдшерский пункт.
В советские годы здание храма Святителя и Чудотворца Николая утратило колокольню и использовалось под зернохранилище.
В 2001 году в Саратовскую епархию обратились жители сел Старая Лопуховка, Белгаза, Озерное Аткарского района с просьбой благословить начало реконструкции Свято-Никольского храма в с.Старая Лопуховка. 7 февраля 2001 года состоялось первое собрание православных верующих села, на котором были избраны члены приходского совета храма. В 2001 году здание храма признано памятником архитектуры областного значения.