В феврале 1736 года помещик, адьютант лейб-гвардии Конного полка князь Иван Алексеевич Салтыков написал в синодальный казённый приказ прошение следующего содержания: «В Владимирской десятине, в Ильмехотском стану, в селе Черкутине имеется деревянная церковь во имя Николая Чудотворца, которая построена в давних годах и от многопрошедших лет весьма обветшала и за ветхостью служить в ней невозможно, и ныне я желаю вместо ветхой деревянной церкви построить вновь каменную церковь во имя тот же престол и прошу о строении.. дать указ». Указ был выдан, и церковь была построена в том же году. Освящена архимандритом Владимирского Рождественского монастыря Павлом. Это был восьмигранный двухсветный храм из кирпича, с трёхъярусной колокольней, поставленный на высоком берегу пруда, в 50-ти метрах от барского дома.
В первой половине ХIХ века храм подвергся перестройке в стиле классицизма. После всех работ храм стал выглядеть таким, каким мы можем видеть на сегодняшний день: основной объём в виде небольшого неравногранного восьмерика перекрыт куполом с главкой, с запада к нему примыкает притвор и колокольня. Никольская церковь сначала была приходской и имела отдельный причт, а с 1849 года стала приписной к церкви Рождества Пресвятой Богородицы с. Черкутино. Престол в ней был один. Утварью, ризницей, святыми образами и богослужебными книгами церковь была снабжена в достаточном количестве.
Рядом с храмом находились строения усадьбы Салтыковых, от которых сохранились дом и флигель ХVIII века. После постройки Салтыковыми новой усадьбы в Снегирёво, дом в Черкутино был передан церковному причту. В доме священника этой церкви, о. Михаила Васильева, 1 января 1772 года родился сын Михаил, будущий государственный деятель Российской империи, граф Михаил Михайлович Сперанский; в Никольском храме будущий реформатор был крещён.
Церковь Николая Чудотворца была закрыта властями в 30-х годов ХХ века и приспособлена под хозяйственные нужды. Здание Никольской церкви сохранилось до наших дней, но требует значительной реставрации. Чудом храм не был разрушен и разобран на кирпич для хозяйственных целей в советское время. Что только не находилось в помещении храма: и котельная психоневрологического диспансера, и баня, и склады, и даже свинарник. Сейчас благодаря стараниям епархии и общественности проводится восстановление храма.
