Село Сям-Можга было основано 1861 году. Тогда же, по указу Священного Синода от 13 марта 1861 года, был открыт приход. Сразу же была заложена и построена первая церковь. Она была деревянная, и построена на средства прихожан. Старостой церкви был назначен Илларион Кокоулин. Освятили ее в честь Святого Василия Великого. Церковь добросовестно служила на благо прихожан: в 1868 году при церкви было открыто церковно-приходское попечительство, а в 1878 году — церковно-приходская школа.
Первым настоятелем церкви был Протоиерей Матфей Кибардин. Этому человеку было суждено сыграть основную роль в основании Михайло-Архангельской церкви. Еще при строительстве деревянной церкви он понимал, что прихожанам будет нужен новый храм. Места тогда здесь были людные. Например, к 1889 году в составе Сям-Можгинского прихода были следующие села и деревни: Вавож, Мултан, Сюмси, Ува-Тукля, Какмож, Кабано-во, Кэйшур, Сюровай, Нуркан, Асаново, Большая Инга, Старцево, Митрейшур, Чежи, Берестово, Мухачево, Русский Уваршур, Маковыр, Ураково, Беренгурт, Гурклуд, Вотский Уватшур, Гульцо, Пуш-товай, Тальяны, Ахтемыр-Ошмес, Малый Сардык.
В 1902 году было начато строительство каменного храма. Строительство велось на средства прихожан и частных благотворителей. Кроме этого, собирались пожертвования на кладку, провизию для строителей. Кроме профессиональной бригады строителей активно помогал строить сам народ. Пять лет потребовалось, чтобы возвести церковь.
Протоирей Матфей Кибардин совсем немного не дожил до окончания строительства церкви в 1907 году. Его дело продолжил сын, священник Василий Кибардин. 9 декабря 1909 года он освятил церковь по благословлению архиепископа Вятского и Слободского Филарета. Главный престол был освящен во имя Архангела Михаила. Деревянная Васильевская церковь после завершения строительства каменного храма была закрыта.
В феврале 1917 года началась революция в Петрограде. Хаос, порожденный революцией, затронул всех в России. Не была исключением и церковь. По описанием очевидцев, в Сям Можге, как и во многих селах и городах того времени, шли бои между красными и белыми. Несмотря на смуту, церковь действовала. Убитых в боях хоронили в общей могиле, которая находится на территории церкви. Приход к власти большевиков повлек за собой санкции против храма. В 1930 году было принято решение закрыть церковь. Закрыть в те года часто значило использовать под различные нужды или уничтожить. По инициативе местного самоуправления снаряжается отряд, который должен был ликвидировать церковь. К счастью, этого не удалось сделать. После этого случая людям стало известно о попытке ликвидировать церковь, многие, чтобы предотвратить новую попытку разрушения, собирали подписи, делали все возможное, чтобы сохранить церковь.
Кроме сбитых со звонницы колоколов новая власть значительного вреда церкви не принесла. Чего не скажешь о людях — свидетельств за долгий период с 1920 года по 1960 год о тех, кто служил в церкви не сохранилось. Известна лишь судьба сына первого настоятеля церкви Василия. Он не был сослан в лагеря, и умер в родном селе. Местные жители даже указывают место, где он захоронен.
С началом Второй мировой войны, как это и бывает в особо тяжелые годы, потребность в храме была настолько сильной, что Михайло-Архангельскую церковь открыли. Это произошло в 1942 году, когда страна переживала одни из самых страшных периодов в своей истории. В период войны в церкви служили священники, имена которых в истории храма не сохранились. Без всякого указа они приезжали в церковь и проводили службы. С тех пор Михайло-Архангельская церковь больше не закрывалась.
В послевоенный период храм частично реставрировался. В 1960-е годы был организован придел, который обеспечивал работу храма в зимнее время, так как не было средств на полноценное отопление. В 1990-е годы, при помощи благотворителей, был произведен ремонт церкви, а в 1992 году ОАО «Ижсталь» были отлиты и установлены новые колокола.
