Приход в с. Малая Пурга Малопургинской волости Сарапульского уезда был открыт на основании указа Святейшего Синода в 1858 году. Вначале церковные службы совершались в молитвенном доме. Первый двуглавый деревянный храм в селе был построен к концу 1860 года и освящен в честь Архистратига Михаила.
В 1902 году вместо ветхой деревянной церкви построен каменный храм с одним престолом. Первый краеугольный камень будущей церкви был заложен в 1897 году. Строительство шло с большими перерывами. Прихожане жили в бедности. Церковная казна пустовала. Настоятель церкви отец Михаил был вынужден перейти в другой приход в с. Дебесы. На его место в 1898 году был назначен новый настоятель – Иоанн Васильев, хорошо владеющий удмуртским языком. Он организовал производство кирпича по особой технологии, с применением яичного белка и желтка в качестве связующего. В строительстве храма помогли пожертвования елабужских купцов И. Г. Стахеева и Ф. П. Гирбасова. К июню 1902 года строительство новой церкви было завершено. Церковь освящена 3 января 1902 года во имя Михаила Архангела. Отца Иоанна сменил священник Александр Нагорный, окончивший Вятскую духовную семинарию.
Храм стал лучшим украшением села. Экстерьер и ограда вокруг были выполнены в новом стиле архитектуры. Внешние стены изобиловали множеством орнаментов и переходов, карнизы – художественной кладкой во всех линиях. Со знанием дела были подобраны два больших и десять маленьких колоколов. Отличался своей звучностью главный колокол, весивший 36 пудов. Благовест его был слышен до шести верст по радиусу.
Начиная с 1917 года, с приходом Советской власти, церковь подвергалась всяческим гонениям, а ее прихожане и церковный причт – репрессиям. Власти дважды закрывали Михаило-Архангельскую церковь. Первый раз – в марте 1930 года. Храм был разгромлен и осквернен, разрушен иконостас, разбиты иконы, разобрана кирпичная кладка ограды. Второй – в июне 1938 года. Здание церкви передавалось Месткому под кузницу, затем в распоряжение Правления потребительского общества под магазин по продаже промышленных и потребительских товаров.
Начиная с 1990 года церковь переживает свое второе возрождение. Построенная на окраине, теперь она оказалась в центре села. Первым настоятелем храма в 1998 году стал отец Анатолий, прибывший из Москвы. Его стараниями были восстановлены паперть и колокольня. Восстановлен в прежнем виде купол храма с его семью главами. Приобретены необходимые принадлежности богослужения. Заново создан многоголосный хор певчих.
В целях оказания помощи в ремонте и благоустройстве территории в 2008 году создан Попечительский совет храма Михаила Архангела с. Малая Пурга при главе муниципального образования «Малопургинский район».