Церковь Марии Сионской сложена из серого камня. Перед храмом можно видеть традиционное место коронации эфиопских императоров, представляющее собой несколько гранитных камней, по форме напоминающих неглубокие кресла. У ворот храма установлена медная пушка.
Внутри церковь расписана яркими фресками. Своды храма опираются на четыре массивных столба, на которых висят картины на сюжеты из Священного Писания. В центре зала висит бронзовая люстра. Алтарь обычно закрыт разноцветным покрывалом.
Стены старых церквей, таких как Дебра Берхан Силассие, как правило, украшены росписями. Художники в те далекие времена имели совсем другое представление о пропорциях, не знали перспективы и объема. Нечто подобное мы встречаем и в русской иконописи.
Главная святыня храма — ларец, называемый Ковчегом завета, — хранится ныне в специальной часовне, построенной в 1965 году в десяти метрах от северо-восточного угла старой церкви. По преданию, в ларце находились золотой сосуд с манной небесной, жезл Аарона, две из десяти скрижалей с заповедями Ветхого завета, полученные Моисеем на горе Синай. В прошлые века Ковчег, накрытый покрывалом зелёного и красного бархата, на большие церковные праздники во главе процессии покидал храм.
