Двухпрестольный Казанский храм в селе Трубетчино построен на средства прихожан в 1890 году на месте прежнего деревянного, находившегося в ветхом состоянии. Главный холодный престол был освящен в честь Казанской иконы Божией Матери, теплый придел освящен в честь Рождества Иоанна Предтечи. Службы в отапливаемом приделе проводились в холодное время года. Здание было построено из дерева на каменном фундаменте.
Приход был очень большой, в 1900 году включал жителей нескольких поселений.
Во время массового закрытия церквей в Средневолжском крае священник Казанского храма с. Тубетчино Николай Николаевич Травин был арестован в 1932 году. Его расстреляли 20 февраля 1938 года в Куйбышеве, ныне Самара.
Накануне Великой Отечественной войны здание церкви подверглось перестройке на том же каменном фундаменте. Вплоть до 2001 года в здании храма располагалась сельская школа, которую закрыли из-за несоответствия здания технике безопасности. Здание выкупила чета Никулиных по благословению протоиерея Григория Коберника. В 2010 году зданию вернули прежний вид. Первый молебен отслужили на праздник Казанской иконы Божией Матери 21 июля 2012 года.
