Деревянных храм был построен и освящён в 1730 году. В 1735 году Т. Мартынов продал часть унаследованной от отца земли своему племяннику А. Мартынову. От Н. Мартынова в 1741 году часть недвижимого имения в Новиковке получила в приданое его дочь П. Киреева. В 1748 году овдовевшая дочь С. Яковлева помещица М. Каракозова получила часть Новиковки вместе с сыном и племянником в наследство. Последние 1754 году продали свою долю М. Пилюгиной. В 1773 году вместо старой церкви была выстроена новая, также деревянная. В середине 1770-х годов после ухода войска Емельяна Пугачёва в окрестностях села ещё некоторое время орудовала одна из его шаек. В 1802 году вдова О. Евсюкова запрашивала разрешение на постройку в Новиковке новой каменной церкви вместо ветхой деревянной, но к 1804 году вновь вышла замуж и своё намерение оставила.
В канун отмены крепостного права в Новиковке в 58 домохозяйствах проживали 344 мужчины и 358 женщин. Рядом проходил просёлочный тракт из Саратова в Кузнецк, в селе работали церковь и открытая 11 марта 1861 года земская школа. 23 сентября 1865 года епископ Саратовский и Царицынский Иоанникий освятил выстроенную вместо старой обветшавшей новую деревянную Иоанно-Предтеченскую церковь. В 1879 году по проекту известного саратовского архитектора К. В. Тидена на средства прихожан была построена четвёртая и последняя в истории Новиковки церковь во имя Иоанна Предтечи. Здание было деревянным на каменном фундаменте, имело колокольню, железную крышу и отопление. При храме имелась деревянная сторожка, церковные дома для священника и псаломщика были построены прихожанами в 1900 году. 29 октября 1901 года в храме освятили устроенный заново престол.
В селе работали церковь и земская школа. В 1917 году в Новиковке насчитывалось 170 дворов, 596 мужчин и 602 женщины. При Советской власти Новиковка стала центром одноимённого сельсовета и некоторое время до образования Базарно-Карабулакского района входила в Вольский уезд. На базе земской школы была создана новая, начальная. Иоанно-Предтеченскую церковь закрыли в годы богоборческих кампаний и впоследствии разрушили. Ныне на её месте установлен поклонный крест.
