Частые наводнения при рекоставе Ангары наносили большой ущерб в хозяйствах прихожан Троицкой церкви. Вследствие этого прихожане дали обет во избежание наводнений построить при церкви храм во имя Святого Георгия Неокессарийского чудотворца. Такой храм в деревянном исполнении был заложен 8 сентября 1802 года. Через несколько лет здание храма обветшало и пришло в полную негодность и в нём прекратились богослужения. Особенно повредили здание храма наводнения 1829-1830 годов, после которых губернский архитектор А.В. Васильев признал церковь Георгия Неокессарийского «очень ветхою и клонящеюся к скорому разрушению». Ремонту она не подлежала, так как «всякая правка была бы бесполезна, не иначе как если разобрать до основания, укрепить снова фундамент и перекласть новую всю». С 23 августа 1836 года церковь распоряжением Духовной консистории закрывается. Но старанием старосты Троицкой церкви Я.С. Малкова собирается достаточная сумма денег для ремонта, и в 1844 году храм исправляется. 4 июня 1845 года, в день праздника сошествия Святого Духа, преосвященным епископом Нилом вновь освящается церковь Георгия Неокессарийского.
Но уже в 1862 году в клировых ведомостях указывается на необходимость значительных ремонтных работ ко исправлению храма. Старанием «тёмного старца» прихожанина Петра Степановича Ивельского начало строиться отдельно стоящее каменное здание храма во имя Георгия Неокессарийского, которое к середине 1863 года и было построено. 2 июня оно освящается архиепископом Парфением и епископом Селенгинским Вениамином в сослужении трёх архимандритов. Рядом расположенный переулок с тех пор стал называться Георгиевским. Кстати говоря, это одна из сохранившихся, правда, в очень изменённом виде, построек по проекту известного иркутского архитектора А.И. Лосева. Представляла из себя каменное ротондольное строение в стиле позднего классицизма.
После большого пожара 1879 года, охватившего всю центральную часть города, церковь Георгия, епископа Неокессарийского, полностью перестраивается и приспосабливается под богадельню. В конце XX века принимается решение о восстановлении храма, входящего в состав комплекса Троицкой церкви, по проекту иркутского архитектора А. Поликарпочкина.