Церковь Двенадцати Апостолов — небольшой древний храм в центре города на Десятинной улице, на территории исторического Загородского конца. Одноглавый храм с изящными пряслами стен с боковыми пониженным лопастями выдержан в традициях новгородской архитектуры XIV века. Восьмискатное покрытие появилось в 1905 году, до этого каждая лопасть имела свою кровлю, создавая плавный силуэт.
Первая деревянная постройка на этом месте впервые упоминалась в летописи за 1230 год и называлась «церковь у скудельни», или «в пропастех». В том году случился страшный голод, и при храме была устроена скудельня, кладбище. Специальный человек по имени Станила свозил сюда умерших со всей округи. В 1454—1455 годах по заказу архиепископа Евфимия было построено современное каменное здание церкви.
В XVI веке внутри церкви появилось перекрытие, разделившее пространство храма на два этажа — подклет и собственно церковное здание. По свидетельству архимандрита Макария Миролюбова, в XIX веке церковь, окруженная садом, была приписана к новгородскому архиерейскому дому, в котором останавливались московские епископы во время визитов в Новгород.
Церковь была повреждена во время Великой Отечественной войны. Реставрация проводилась с несколько этапов, с 1949 года по 2008 год. В настоящее время храм закрыт, возможен осмотр только снаружи.