Изначально село носило название Зиняково и принадлежало к Семеновскому уезду Нижегородской Губернии. Село входило в состав имений Дурново. В Адресной книге Нижегородской епархии на 1904 год следующие сведения о храме: Храм деревянный 1765 года, престолы: главный холодный Святого Алексия митрополита Московского, придел теплый Святого Иоанна Затоустого. Земли около 32 десятин, лесу 4 десятины. Дом священника собственный, псаломщика квартира. Казенного жалования 392 р.; прочий капитал 150 р. В приходе 24 дома, православных 622 муж., 748 жен., раскольников, старообрядцев, 11 муж., 11 жен.; церковно-приходская школа. Настоятель иерей Петр Сергеевич Сперанский, 55 лет, окончил семинарию, в приходе с 1889 года, законоучитель, имеет камилавку. Псаломщик В.И. Никольский, 36 лет, из 3 класса духовного училища, в приходе с 1892 года. Церковный староста Н.А. Медведев.
Каменный храм строился с 1900 года по 1913 год предположительно по проекту арх. А.К. Никитина. 22 сентября 1913 года был освящен центральный престол во имя святителя Алексия, митрополита Московского. Боковые приделы были посвящены в честь святого Иоанна Златоуста и святителя Николая Чудотворца. К 1914 году боковые престолы не были освящены. Последним настоятелем перед закрытием храма был сын Петра Сергеевича Сперанского – Сергей Петрович Сперанский.
В советское время в церкви был склад. В настоящее время храм действующий.
Храм расположен в центре села Зиняки на ровном рельефе и обращен западным фасадом к главной площади. Восточным фасадом церковь примыкает к территории сельского кладбища. Алексеевская церковь имеет широко распространенное симметрично-осевое построение: вдоль единой продольной оси запад — восток располагаются притвор, храмовая часть и алтарь.
Церковь была построена с трехъярусной каменной колокольней над притвором, квадратной в плане, с массивным цилиндрическим барабаном, увенчанным крупной луковичной главой. Колокольня, а также первоначальные ложные барабаны с главами были разрушены после 1936 года. Существующие в настоящее время барабаны и главы храма вновь возведены в 1990-х годах с изменением прежних пропорций и декора.
Памятник доминирует в окружающем пейзаже. Церковь представляет интерес как образец каменного сельского храма начала XX века в духе эклектики.
