Церковь во имя выдающегося деятеля Русской Церкви XIV в. святителя Петра митрополита Московского (Киевского) построена в 1911-1912 годах при подворье Свято-Троицкого Творожковского женского монастыря Санкт-Петербургской епархии в бывшей Московской Ямской слободе. В 1903 году купец 2-й гильдии, домовладелец Петр Евграфович Семенов и его супруга Александра Филипповна купили порожний участок на углу Екатеринославской (современной Днепропетровской) и Роменской улиц и обратились с ходатайством о строительстве на нем «каменного дома с церковью». Прошение было одобрено Императором 3 июля 1911 г. Комплекс каменных зданий был сооружен в 1911-1912 гг. по проекту епархиального архитектора, гражданского инженера А. П. Аплаксина, выдающегося мастера неорусского стиля. Он включает в себя храм шатровой формы с примыкающей к ней часовней и звонницей над последней, а также связанный с храмом переходом келейный корпус.
Редкой особенностью архитектуры подворья является сочетание стилизованных деталей и композиции, свойственных зодчеству Древней Руси («псковско-новгородскому», а также московских шатровых храмов XVI в.). Здания отличаются сложной асимметричной композицией с завершениями необычной формы, высоким качеством отделки с применением монументальной живописи на фасаде. Главный придел верхнего храма во имя Святителя Петра был освящен 2 декабря 1912 года, южный придел — в честь Пресвятой Троицы в 1913 году, главный придел нижнего храма освящен в 1919 году cвященномученником Вениамином, митрополитом Петроградским во имя Святителя Николая Чудотворца, в том же году южный придел нижнего храма — во имя Святой Равноапостольной Великой Княгини Ольги.
По воспоминаниям очевицев, подворье с церковью представляло собой великолепный образец храмовой архитектуры. Вместе с балокаменным Феодоровским собором, построенном в московском стиле, они являлись важной архитектурной доминантой при въезде в С.-Петербург, своим светлым обликом отождествляя духовное родство двух столиц. Богатым и изысканным было и внутреннее убранство церкви свт. Петра. Пятиярусный иконостас, выполненный по образцу иконостаса Успенского собора московского Кремля с ликом Феодоровской иконы Божией Матери, покровительницы дома Романовых, зримо подчеркивал духовную связь Москвы и Петербурга.
С 1919 года храм получил статус приходского, принадлежал до 1927 года Патриаршей церкви. В 1922 году, несмотря на сопротивление верующих, представителями власти были изъяты церковные ценности. Храм закрыт 22 марта 1930 г. В 1932 году здания переданы заводу «Гидравлик». К 1939 году были разобраны шатровые завершения церкви и четыре малых барабана с луковичными главками, крыльца, кокошники — щипцы и кровля, здания перестроены, уничтожены наружные росписи и внутреннее убранство в древнерусском стиле.
9 августа 1994 года распоряжением мэрии Санкт-Петербурга подворье возвращено Санкт-Петербургской епархии под богослужебные цели прихода. Зарегистрирован он был и в Комитете ГИОП как памятник архитектуры.
С этого времени ведутся реставрационные работы по проектной документации «Ленпроектреставрации». С 1992 года здесь совершаются богослужения. Впереди основной этап реставрации. Сложные работы предстоят по восстановлению пятиярусного иконостаса, монументальной фасадной живописи, уничтоженных архитектурных деталей: золоченого креста, шатрового завершения и четырех луковичных барабанов.
К сожалению, в помещённой выше пространной статье Александра Разумова, из-за отсутствия доступа к архивным документам, имеется серьёзная неточность: Согласно клировой ведомости этого храма, составленной его настоятелем свящ. Константином Митропольским в начале 1915г., главный престол верхнего храма был освящён 24 Марта 1913г. во имя Святой Троицы. Правый боковой придел вехнего храма был освящён во имя св. Княгини Ольги и св. муч. Царицы Александры 18 Ноября 1912г. Главный придел нижнего храма был освящён во имя святителя Петра,митрополита Киевского 2 Декабря 1912г.
Что касается придела в Трапезной, то он был освящён во имя Святителя Николая Чудотворца лишь 27 Октября 1919г. К сожалению, в 1992-2002гг. ЦГИА СПб, в котором хранятся эти документы был закрыт на капитальный ремонт, и приделы в возвращённом храме были не только перепутаны, но даже (по незнанию) изменены в названиях: так, в настоящее время главный придел верхнего храма освящён во имя Святителя Петра, митрополита Московского(!), а правый боковой (!) придел — во имя Святой Троицы. Возвращать исторические названия приделам сейчас никто уже не хочет — мы, мол, уже привыкли…
ЦГИА СПб, ф.19, оп.113, д.4285, лл.270-271, 1914г.