Место обретения иконы Казанской Божией Матери заслуживает особого внимания. Чудесное событие обретения иконы Божией Матери в 1579 году прославило Россию. И сегодня христиане всего мира чествуют Казань как место чудесного явления Девы Марии. Это святое место признано и посещаемо всеми христианами: и православными, и старообрядцами, и даже католиками. Царь Иван Васильевич Грозный повелел поставить церковь на месте, где была обретена чудотворная Икона и «устроить девический монастырь, келии поставить и ограду соорудить». Указ царя выполнили. Построили деревянную церковь во имя святой Богородицы Одигитрии и монастырскую ограду. В 1595 году была построена каменная церковь, которая прослужила до 1798 года. Именно в этом году 30 мая заложен новый собор, освященный в 1808 году. Мысль о построении часовни на месте явления чудотворной иконы Казанской Божией Матери возникла при посещении Казани великой княгиней Елисаветой Феодоровной 13 июля 1910 года. Перед своим отъездом из обители ее высочество изъявила желание побывать на месте самого явления святой чудотворной иконы Божией Матери, которое находилось под алтарем главного монастырского храма. Великая княгиня спустилась в нижний, подвальный, этаж собора, долго молилась там и выразила сожаление, что такое святое место находится в запущенном состоянии. Игуменья монастыря Варвара предложила Елисавете Феодоровне устроить на месте явления чудотворной Казанской иконы Божией Матери часовню в память приближающегося трехсотлетия царствования дома Романовых на русском престоле. При этом было предложено ее высочеству принять под свое покровительство ход строительства часовни, на что великая княгиня изъявила полное свое согласие и радость послужить этому святому делу.
Советское время не пощадило величественный Казанско-Богородицкий монастырь. Соборный храм Казанской иконы Божией Матери использовался под склад для хлеба, причем зерно ссыпали прямо под иконостас, а в 1932 году он был разрушен вместе со святым местом обретения иконы Казанской Божией Матери. Рядом с разрушенным храмом из его кирпича были возведены павильоны для кинофабрики «Востоккино», впоследствии в них в годы войны разместились эвакуированные в Казань табачные фабрики. Место, где стоял бывший храм, было частично заасфальтировано, на нем был устроен хозяйственный двор и построена проходная табачной фабрики. После передачи данной территории возрожденному монастырю, археологическая экспедиция под руководством профессора Казанского университета З. М. Слепака летом 2000 года осуществила здесь раскопки. Цель археологических исследований, поиск следов летнего, холодного, храма, а также находящегося в нем пещерного храма. Раскопками обнаружены следы искомого сооружения, вернее, часть его апсиды, где и был вход в «пещерную» часовню собора. Именно здесь и была в 2008 году по благословлению архиепископа Казанского и Татарстанского Анастасия поставлена часовня в память о месте обретения иконы Казанской Божией Матери.