Инженер путей сообщения, один из основоположников паровозостроения в России, профессор.
В 1879 г. организовал первую в стране лабораторию топлива, воды и смазки на Юго-Западной железной дороге, в 1880-1882 гг. создал первую в мире паровозную лабораторию на базе Киевских мастерских.
Совместно с Л. М. Леви разработал методику стационарных испытаний паровозов. В 1885 г. по проекту Бородина построен первый паровоз тандем-компаунд.
Один из основателей и редакторов журнала «Инженер» (1882, Киев), с 1889 г. — главный редактор журнала. Русское техническое общество учредило Золотую медаль им. Бородина за лучшие изобретения и исследования в области железнодорожного транспорта.